More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1712 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0065  ATP synthase F1 subunit alpha  68.13 
 
 
532 aa  736    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.03 
 
 
526 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.8 
 
 
526 aa  697    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0315  ATP synthase F1, alpha subunit  68.44 
 
 
534 aa  728    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.09 
 
 
526 aa  703    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0396  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.67 
 
 
524 aa  840    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.99 
 
 
526 aa  704    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.98 
 
 
504 aa  642    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4632  ATP synthase F1, alpha subunit  73.09 
 
 
525 aa  781    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0663006  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03060  ATP synthase subunit A  85.5 
 
 
524 aa  915    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.76 
 
 
526 aa  803    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6523  ATP synthase F1, alpha subunit  76.15 
 
 
524 aa  814    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1233  ATP synthase F1, alpha subunit  76.38 
 
 
525 aa  823    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1712  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
526 aa  1055    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000192165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.33 
 
 
526 aa  701    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.9 
 
 
526 aa  694    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1059  F0F1 ATP synthase subunit alpha  83.4 
 
 
525 aa  896    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.83 
 
 
526 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.91 
 
 
510 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.69 
 
 
502 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.34 
 
 
509 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  60.53 
 
 
509 aa  621  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.15 
 
 
502 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.89 
 
 
509 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.15 
 
 
509 aa  624  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.23 
 
 
510 aa  621  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.58 
 
 
509 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.18 
 
 
502 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
509 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 
509 aa  621  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 
509 aa  621  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 
509 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.01 
 
 
509 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.39 
 
 
509 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.75 
 
 
508 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.28 
 
 
510 aa  615  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  59.36 
 
 
509 aa  615  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 
509 aa  618  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  60.04 
 
 
507 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.15 
 
 
509 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.58 
 
 
509 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.01 
 
 
510 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.39 
 
 
509 aa  618  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  61.11 
 
 
507 aa  616  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.81 
 
 
512 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.07 
 
 
502 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.74 
 
 
510 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.81 
 
 
502 aa  613  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  59.66 
 
 
501 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.47 
 
 
510 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.66 
 
 
510 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.47 
 
 
510 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.2 
 
 
510 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.58 
 
 
512 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.07 
 
 
502 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.74 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.54 
 
 
502 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.43 
 
 
503 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  58.44 
 
 
509 aa  609  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.48 
 
 
502 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.55 
 
 
510 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.86 
 
 
505 aa  608  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  59.08 
 
 
501 aa  610  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  60.54 
 
 
507 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.71 
 
 
510 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  59.09 
 
 
510 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.55 
 
 
510 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.68 
 
 
502 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.71 
 
 
509 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.59 
 
 
509 aa  610  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.73 
 
 
502 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.73 
 
 
502 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.48 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.13 
 
 
503 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.81 
 
 
503 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.42 
 
 
501 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.58 
 
 
510 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.48 
 
 
505 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 
509 aa  608  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  58.62 
 
 
508 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  59.46 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.13 
 
 
503 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1315  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.24 
 
 
512 aa  607  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  59.34 
 
 
502 aa  608  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.66 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.19 
 
 
503 aa  601  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.08 
 
 
501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02280  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor, putative  58.49 
 
 
540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.98 
 
 
502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.88 
 
 
501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0972  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.41 
 
 
512 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.41 
 
 
512 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.89 
 
 
502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.89 
 
 
502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.82 
 
 
504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.98 
 
 
502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
502 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.02 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3816  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.29 
 
 
511 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905134  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  56.17 
 
 
507 aa  599  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>