More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0301 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  100 
 
 
106 aa  217  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  79.05 
 
 
105 aa  183  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  65.71 
 
 
105 aa  151  3e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1343  thioredoxin  73.33 
 
 
105 aa  151  3e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.8 
 
 
115 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  54.29 
 
 
104 aa  130  8e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  55.45 
 
 
110 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  55.24 
 
 
110 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  52.88 
 
 
114 aa  127  4e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  53.85 
 
 
106 aa  126  1e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  49.04 
 
 
107 aa  124  4e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  51.92 
 
 
108 aa  123  8e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  55.45 
 
 
109 aa  123  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  49.06 
 
 
107 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.45063e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  51.46 
 
 
109 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  56.52 
 
 
107 aa  121  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  50.5 
 
 
109 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.55865e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51.92 
 
 
107 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  54.9 
 
 
106 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  47.57 
 
 
133 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  51.49 
 
 
109 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  121  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  47.06 
 
 
110 aa  121  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  50.5 
 
 
109 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  51.92 
 
 
107 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  53.33 
 
 
105 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  51.92 
 
 
107 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  55 
 
 
109 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  45.71 
 
 
105 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  47.57 
 
 
110 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  120  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50.48 
 
 
120 aa  120  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  49.51 
 
 
108 aa  120  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  120  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  51.92 
 
 
124 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  55.32 
 
 
105 aa  120  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  49.02 
 
 
109 aa  120  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  119  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.49 
 
 
148 aa  119  1e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  119  1e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  1e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  119  1e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  1e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  50.5 
 
 
106 aa  119  2e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  118  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  118  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  119  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  48.45 
 
 
107 aa  119  2e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  51.49 
 
 
108 aa  119  2e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  8.66569e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  54.46 
 
 
112 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  1.21318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  54.26 
 
 
105 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  50.96 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  49.02 
 
 
109 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  54.46 
 
 
112 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.65425e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  50.49 
 
 
107 aa  117  4e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  54.35 
 
 
110 aa  117  5e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  52 
 
 
108 aa  117  5e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  54.64 
 
 
110 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  47.12 
 
 
109 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  53.61 
 
 
110 aa  117  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  49.02 
 
 
106 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  45.63 
 
 
110 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  45.63 
 
 
110 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  48.54 
 
 
108 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.17679e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  50.51 
 
 
106 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.83291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  51.09 
 
 
107 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  54.35 
 
 
108 aa  117  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  47.06 
 
 
146 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  48.57 
 
 
107 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  47.52 
 
 
108 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>