More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1694 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 296 aa  603  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  61.77 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  58.25 
 
 		 299 aa  328  8e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  54.64 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.88 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.38 
 
 		 297 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  54.24 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  43.15 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  38.38 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  41.2 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  40.56 
 
 		 284 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  40.77 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  42.81 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  41.67 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.16 
 
 		 286 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  42.65 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  39.19 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  40 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.75 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  39.25 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  40.85 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.28 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  42.11 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  41.11 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  39.02 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  33.78 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  36.63 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  39.12 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  43.17 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.42 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  39.49 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  40 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  39.72 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.53 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  39.93 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.37 
 
 		 280 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  34.63 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  37.41 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  36.17 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.76 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  36.4 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  34.03 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.81 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.24 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  39.72 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  39.72 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  33.9 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.1 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.5 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  33.22 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  36 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  32.88 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  37.72 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  38.33 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  33.22 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  32.88 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.42 
 
 		 283 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.57 
 
 		 283 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  37.22 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  33.22 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  33.22 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.4 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  37.87 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.22 
 
 		 283 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.22 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  41.09 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  32.53 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  32.86 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  33.22 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  37.91 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.74 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.22 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  35.82 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.52 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  33.92 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.8 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  36.4 
 
 		 299 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  35.4 
 
 		 288 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  34.03 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  36.7 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  32.76 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  32.76 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  32.76 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  36.04 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  32.76 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.69 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.56 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  36.16 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  32.76 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  36.52 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  33.68 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.76 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  34.94 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.19 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.32 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  35.07 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>