More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0876 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  100 
 
 		 205 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  78.54 
 
 		 205 aa  344  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  75.12 
 
 		 204 aa  323  8.000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  74.27 
 
 		 204 aa  321  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  74.63 
 
 		 204 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  74.63 
 
 		 204 aa  315  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  73.17 
 
 		 204 aa  307  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  55.3 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  53.17 
 
 		 199 aa  234  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  55.12 
 
 		 199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  53.17 
 
 		 198 aa  231  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  53.17 
 
 		 198 aa  231  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  54.95 
 
 		 199 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  54.46 
 
 		 198 aa  226  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  55.12 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  53.96 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  54.59 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  54.12 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  55.9 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  53.54 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  53.54 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  54.36 
 
 		 198 aa  217  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  52.82 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  50.24 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  53.54 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  53.54 
 
 		 198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 198 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  51.98 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  53.5 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  53.85 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  52.02 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  51.56 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  51.52 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  49.5 
 
 		 199 aa  207  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  52.31 
 
 		 198 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  52.82 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  52.82 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  48.98 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  48.5 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  48.24 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  49.25 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  49.26 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  51.23 
 
 		 197 aa  204  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  49.76 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  48.74 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  48 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  50 
 
 		 203 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  49.27 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  54.4 
 
 		 197 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  49 
 
 		 197 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  47.74 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  48.74 
 
 		 198 aa  201  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4329  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.63547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  54.4 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  54.4 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  53.85 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  49 
 
 		 199 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  50 
 
 		 198 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  49.26 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  47.5 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  49.25 
 
 		 203 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  46.08 
 
 		 204 aa  197  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  46.08 
 
 		 203 aa  197  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  49 
 
 		 204 aa  197  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  48.99 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  47.18 
 
 		 199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  48.29 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  49.23 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  50 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  49.25 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  47.5 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  47 
 
 		 197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  47.98 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  49.75 
 
 		 198 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  46.04 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  50.51 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  47.74 
 
 		 194 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 189 aa  193  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  49.23 
 
 		 199 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  48.24 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  48.98 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>