60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03800 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  67.23 
 
 		 180 aa  227  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  58.1 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  36.41 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  30.86 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  30.86 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  27.06 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  29.78 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  30.34 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  28.9 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  30.23 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  29.66 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  30.06 
 
 		 166 aa  62  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  25.58 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2977  protein of unknown function DUF901  26.37 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  32.72 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  30.59 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3193  protein of unknown function DUF901  25.97 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.747154  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  31.86 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2903  protein of unknown function DUF901  25.97 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  30.59 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  38.26 
 
 		 517 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  33.08 
 
 		 507 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  26.09 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  33.33 
 
 		 470 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  30.5 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  26.11 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  26.11 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  28.67 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  24.83 
 
 		 885 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  31.54 
 
 		 518 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  31.54 
 
 		 519 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  32.74 
 
 		 434 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  24.72 
 
 		 888 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  26.32 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  32.23 
 
 		 437 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  34.17 
 
 		 440 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  28.67 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  21.82 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  29.23 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  27.34 
 
 		 425 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0210  hypothetical protein  26.52 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  33.33 
 
 		 441 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  29.83 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  27.71 
 
 		 880 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  27.82 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  33.64 
 
 		 484 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3775  hypothetical protein  25.28 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000635481  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  24.44 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  27.48 
 
 		 177 aa  41.2  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  30.83 
 
 		 471 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>