More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3479 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  100 
 
 
534 aa  1099    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  64.45 
 
 
532 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  49.8 
 
 
532 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  48.84 
 
 
542 aa  479  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  49.23 
 
 
538 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  47.18 
 
 
528 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  46.49 
 
 
537 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  47.89 
 
 
531 aa  458  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  47.01 
 
 
529 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  46.7 
 
 
533 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  45.37 
 
 
532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  46.55 
 
 
531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  47.44 
 
 
531 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  45.9 
 
 
541 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  45.94 
 
 
531 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  44.87 
 
 
533 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  46.55 
 
 
531 aa  445  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  45.51 
 
 
531 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  45.12 
 
 
522 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  44.59 
 
 
534 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  46.07 
 
 
531 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  45.33 
 
 
531 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  45.12 
 
 
531 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  44.93 
 
 
538 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  44.76 
 
 
533 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  43.61 
 
 
542 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  44.38 
 
 
539 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  46.41 
 
 
515 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  44.76 
 
 
533 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 
531 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  44.14 
 
 
565 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  44.05 
 
 
555 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  44.83 
 
 
541 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  43.82 
 
 
539 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  45.79 
 
 
515 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 
571 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  44.75 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  44.05 
 
 
534 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 
541 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  45.67 
 
 
538 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  45.67 
 
 
538 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  43.76 
 
 
863 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  44.3 
 
 
556 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  44.34 
 
 
532 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  44.93 
 
 
523 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  43.76 
 
 
533 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  44.59 
 
 
536 aa  415  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.69 
 
 
532 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.52 
 
 
535 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  43.5 
 
 
532 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 
502 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  44.36 
 
 
533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  43.94 
 
 
535 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  41.94 
 
 
538 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  42.62 
 
 
609 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  43.36 
 
 
530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  42.53 
 
 
552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  42.69 
 
 
535 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 
535 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  44.13 
 
 
535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  43.73 
 
 
529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  42.24 
 
 
545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  41.52 
 
 
538 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 
570 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 
552 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 
535 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  42.52 
 
 
867 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 
533 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 
570 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  42.2 
 
 
534 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  43.65 
 
 
536 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  44.27 
 
 
533 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  43.3 
 
 
533 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 
570 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  41.52 
 
 
538 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 
570 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 
570 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  43.8 
 
 
847 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  42.14 
 
 
543 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  43.5 
 
 
533 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 
534 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  42.05 
 
 
533 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  42.28 
 
 
534 aa  399  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 
536 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  41.36 
 
 
538 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 
525 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  43.42 
 
 
525 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  43.47 
 
 
528 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 
534 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  43.97 
 
 
537 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  43.36 
 
 
535 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  42.97 
 
 
544 aa  402  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  42.41 
 
 
542 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  42.97 
 
 
536 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  43.86 
 
 
528 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  41.36 
 
 
538 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  43.8 
 
 
528 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 
537 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 
529 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>