More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3185 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  100 
 
 
391 aa  813  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.14817e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  53.98 
 
 
397 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.48039e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  53.73 
 
 
394 aa  453  1e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  2.99069e-08 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  51.17 
 
 
390 aa  397  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  3.88923e-08  unclonable  5.8197e-19 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  47.07 
 
 
393 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  47.07 
 
 
393 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  47.07 
 
 
393 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.03791e-05  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  45.74 
 
 
391 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  45.81 
 
 
390 aa  360  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  43.15 
 
 
386 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  41.8 
 
 
401 aa  341  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  40.72 
 
 
393 aa  338  1e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  41.6 
 
 
397 aa  336  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  4.74096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  40.51 
 
 
393 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  42.53 
 
 
386 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 
389 aa  330  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  41.65 
 
 
400 aa  330  3e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  38.76 
 
 
383 aa  325  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  39.21 
 
 
383 aa  325  8e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  41.33 
 
 
392 aa  325  8e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  42.49 
 
 
412 aa  322  1e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  40.2 
 
 
393 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  6.80188e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  40.46 
 
 
386 aa  313  4e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  38.42 
 
 
383 aa  312  7e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  38.42 
 
 
383 aa  312  7e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  38.46 
 
 
386 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  38.16 
 
 
383 aa  310  3e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  38.16 
 
 
383 aa  310  3e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  38.42 
 
 
383 aa  310  3e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  38.16 
 
 
383 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  37.89 
 
 
383 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 
405 aa  308  1e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  37.89 
 
 
383 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  37.89 
 
 
383 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  39.22 
 
 
391 aa  306  5e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  38.75 
 
 
409 aa  304  2e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  40.84 
 
 
372 aa  298  9e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  37.69 
 
 
383 aa  297  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 
398 aa  295  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  39.02 
 
 
393 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  38.24 
 
 
394 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  37.6 
 
 
404 aa  291  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  37.91 
 
 
397 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  8.68394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  36.65 
 
 
387 aa  290  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  37.2 
 
 
392 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  37.2 
 
 
392 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  37.21 
 
 
393 aa  283  3e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 
392 aa  283  3e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  36.13 
 
 
390 aa  283  3e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  36.96 
 
 
396 aa  283  3e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  38.56 
 
 
395 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  37.18 
 
 
396 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  36.13 
 
 
389 aa  279  7e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  37.76 
 
 
521 aa  275  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  36.57 
 
 
390 aa  273  5e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  36.57 
 
 
390 aa  272  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  38.66 
 
 
392 aa  269  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77087e-11 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  37.93 
 
 
394 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  36.8 
 
 
394 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  35.92 
 
 
390 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  37.66 
 
 
389 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  37.53 
 
 
385 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 
385 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  37.83 
 
 
399 aa  264  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  34.77 
 
 
390 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  36.07 
 
 
400 aa  263  5e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  34.37 
 
 
387 aa  259  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  35.09 
 
 
387 aa  258  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  34.61 
 
 
390 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  5.60226e-05 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  35.57 
 
 
402 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  35.57 
 
 
402 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  35.46 
 
 
386 aa  255  1e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  35.32 
 
 
402 aa  254  2e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 
402 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 
390 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  34.95 
 
 
399 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  35.82 
 
 
385 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 
385 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  32.82 
 
 
388 aa  249  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  37.27 
 
 
400 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 
386 aa  248  9e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  37.27 
 
 
400 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  37.27 
 
 
400 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  35.07 
 
 
402 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  37.01 
 
 
400 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  35.38 
 
 
385 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  37.27 
 
 
400 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  34.27 
 
 
387 aa  244  2e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  1.56908e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  35.38 
 
 
383 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  31.51 
 
 
393 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 
379 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  35.68 
 
 
384 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  34.37 
 
 
381 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  33.33 
 
 
396 aa  232  7e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  32.11 
 
 
390 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  34.26 
 
 
390 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  34.18 
 
 
395 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  31.62 
 
 
390 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 
390 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  31.62 
 
 
390 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>