More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1287 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  100 
 
 
356 aa  726    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  41.53 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  41.13 
 
 
354 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  39.34 
 
 
362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  38.38 
 
 
350 aa  253  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.36 
 
 
366 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  34.94 
 
 
364 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  34.94 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  34.38 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  35.22 
 
 
364 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  34.38 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.69 
 
 
358 aa  225  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.92 
 
 
375 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.34 
 
 
360 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  34.87 
 
 
361 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.27 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  33.8 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.36 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 
399 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.43 
 
 
379 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.04 
 
 
370 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.89 
 
 
361 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  35.98 
 
 
359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  34.64 
 
 
358 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  34.36 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.51 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.23 
 
 
352 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  33.51 
 
 
368 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  31.93 
 
 
863 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  35.69 
 
 
368 aa  186  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  35.69 
 
 
368 aa  186  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.56 
 
 
368 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  31.55 
 
 
863 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  34.84 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  32.2 
 
 
852 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  32.96 
 
 
363 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  28.91 
 
 
366 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.15 
 
 
362 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
340 aa  175  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 
371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
360 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.17 
 
 
498 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  30.96 
 
 
864 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.45 
 
 
356 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  27.98 
 
 
357 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  32.96 
 
 
352 aa  170  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 
378 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  29.03 
 
 
371 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  29.03 
 
 
371 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 
371 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  34.62 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.4 
 
 
364 aa  166  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.69 
 
 
498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 
360 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 
370 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 
374 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 
342 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
351 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  31.18 
 
 
366 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 
374 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  29.04 
 
 
367 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 
358 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 
366 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  28.57 
 
 
371 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.19 
 
 
361 aa  156  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.45 
 
 
356 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 
374 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  29.45 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.25 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  29.59 
 
 
363 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  30.68 
 
 
386 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.77 
 
 
362 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.73 
 
 
364 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
371 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  29.43 
 
 
372 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
370 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  27.76 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  28.33 
 
 
858 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  30.21 
 
 
373 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  31.86 
 
 
357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.42 
 
 
496 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  34.46 
 
 
348 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
358 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.2 
 
 
332 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
362 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  29.5 
 
 
370 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 
355 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
374 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  31.85 
 
 
364 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  28.2 
 
 
392 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.45 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  26.27 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.01 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  29.89 
 
 
362 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  30.7 
 
 
365 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>