220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1034 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
315 aa  649  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.16866e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
315 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.0557e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  31.61 
 
 
315 aa  189  6e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.61 
 
 
315 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.50924e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.61 
 
 
315 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.61 
 
 
315 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  31.61 
 
 
315 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.28989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.61 
 
 
316 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.44844e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.29 
 
 
315 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.61 
 
 
315 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
315 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  31.29 
 
 
315 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
310 aa  184  1e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.56303e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
307 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
317 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  29.71 
 
 
321 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  26.62 
 
 
323 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  30.57 
 
 
313 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 
308 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  27.3 
 
 
320 aa  154  3e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  25.64 
 
 
327 aa  152  9e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 
324 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  27.96 
 
 
322 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
335 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
357 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  29.81 
 
 
316 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.12012e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  28.95 
 
 
324 aa  145  8e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90118e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.7 
 
 
328 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  29.52 
 
 
314 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  29.52 
 
 
314 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  27.36 
 
 
317 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  7.19741e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
314 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  29.26 
 
 
319 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
339 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
320 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
339 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  24.6 
 
 
315 aa  139  5e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
334 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
312 aa  137  3e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  24.28 
 
 
315 aa  137  3e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
312 aa  137  3e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  24.28 
 
 
315 aa  137  3e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  26.62 
 
 
310 aa  136  6e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  28.24 
 
 
694 aa  135  7e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  28.33 
 
 
694 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
341 aa  135  1e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  24.27 
 
 
326 aa  134  2e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  26.2 
 
 
310 aa  134  2e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  27.18 
 
 
317 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  25.8 
 
 
316 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 
310 aa  132  7e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
333 aa  132  1e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  25.8 
 
 
310 aa  131  1e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16017e-06 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  25.4 
 
 
310 aa  131  1e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  25.4 
 
 
310 aa  131  1e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  26.3 
 
 
331 aa  132  1e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  25.56 
 
 
315 aa  131  2e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  29.21 
 
 
310 aa  130  2e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.52212e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  25.32 
 
 
339 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  25.32 
 
 
339 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 
339 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  24.28 
 
 
316 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  25.32 
 
 
339 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  25.32 
 
 
339 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  26.2 
 
 
306 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  25.32 
 
 
339 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  25.32 
 
 
339 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  25.97 
 
 
319 aa  129  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  25.97 
 
 
319 aa  129  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  25.97 
 
 
319 aa  129  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  25.97 
 
 
319 aa  129  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  26.71 
 
 
317 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  25.97 
 
 
319 aa  129  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  29.24 
 
 
695 aa  129  7e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  25.96 
 
 
326 aa  129  8e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
317 aa  129  9e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  26.71 
 
 
317 aa  129  9e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  26.71 
 
 
317 aa  129  9e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  25.24 
 
 
319 aa  128  1e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  25.24 
 
 
313 aa  128  1e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  25.24 
 
 
362 aa  128  1e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
310 aa  128  1e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  27.33 
 
 
700 aa  128  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
339 aa  127  2e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
333 aa  127  2e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  26.14 
 
 
333 aa  127  2e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  26.38 
 
 
317 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
339 aa  126  4e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  25.99 
 
 
334 aa  126  4e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  26.6 
 
 
331 aa  127  4e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
339 aa  126  4e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
335 aa  127  4e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
339 aa  126  4e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  27.39 
 
 
319 aa  126  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  26.35 
 
 
333 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  25.96 
 
 
321 aa  125  8e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  25.64 
 
 
332 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  26.38 
 
 
317 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  26.03 
 
 
333 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  24.84 
 
 
316 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>