258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0531 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0531  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
93 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  41.25 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  48.57 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  43.94 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0957  protein translocase subunit yajC  51.76 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 
116 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  38.95 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  31.87 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  34.52 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  44.05 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  42.37 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  32.5 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3437  preprotein translocase, YajC subunit  40.28 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.616709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  42.37 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  36.05 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  36.05 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  36.05 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  36.05 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  36.05 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
111 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  38.71 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  34.94 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  34.94 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  39.34 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  41.18 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  33.72 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0942  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.129581  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.71 
 
 
106 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 
110 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
111 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  37.8 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  40.68 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 
110 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  36.07 
 
 
146 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  30.38 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  30.38 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  37.29 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  34.83 
 
 
117 aa  50.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  44.64 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.88 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  29.76 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  35.96 
 
 
117 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  32.1 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  35 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  32.88 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1605  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.257286  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  31.51 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  31.51 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  37.08 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  37.88 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  32.79 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  32.79 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0715  preprotein translocase, YajC subunit  37.33 
 
 
86 aa  49.7  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  42.62 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  37.29 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>