More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5208 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 241 aa  460  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  42.78 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  42.22 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  41.03 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.33 
 
 		 668 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  43.6 
 
 		 176 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  38.27 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  40.67 
 
 		 681 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  38.95 
 
 		 176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  42.14 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  40.88 
 
 		 176 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  40.52 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  41.51 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  38.99 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  39.51 
 
 		 173 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  39.51 
 
 		 173 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  38.89 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  40.35 
 
 		 176 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  40.13 
 
 		 173 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  35.88 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.13 
 
 		 438 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  37.04 
 
 		 173 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.84 
 
 		 671 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.67 
 
 		 676 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  34.12 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  43.61 
 
 		 672 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  35.29 
 
 		 176 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  41.1 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  35.5 
 
 		 641 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  41.35 
 
 		 677 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  34.16 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  34.66 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  31.97 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  31.97 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  31.97 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.56 
 
 		 664 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  44.36 
 
 		 672 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  31.07 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  28.21 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.92 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  29.74 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  32.58 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  32.58 
 
 		 179 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  28.21 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.26 
 
 		 664 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.69 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  31.91 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  30.51 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  30.85 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 		 214 aa  85.9  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  29.76 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  29.76 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  29.76 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  29.76 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  29.76 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  30.97 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  28.72 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  34.36 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  29.79 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.65 
 
 		 702 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  30.41 
 
 		 682 aa  83.2  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  30.41 
 
 		 682 aa  83.2  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  36.49 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.99 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  33.95 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  32.58 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  32.11 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  36.3 
 
 		 678 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  33.12 
 
 		 678 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  32.93 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  35.88 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  32.95 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  41.48 
 
 		 672 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.12 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  35.85 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  28.66 
 
 		 695 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  34.36 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  32.73 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.12 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  32.19 
 
 		 686 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  29.9 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  32.75 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  32.75 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>