More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0097 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
151 aa  298  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  78.81 
 
 
151 aa  249  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  5.08651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  81.63 
 
 
151 aa  245  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  80.79 
 
 
151 aa  244  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.81135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  80.79 
 
 
151 aa  241  2e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  72.79 
 
 
148 aa  219  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  71.62 
 
 
148 aa  216  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.23092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  48 
 
 
150 aa  133  7e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 
167 aa  132  1e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  45.03 
 
 
159 aa  132  2e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  51.43 
 
 
148 aa  132  2e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  131  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.15624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 
147 aa  131  4e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.75 
 
 
147 aa  130  7e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.98897e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  47.22 
 
 
147 aa  128  2e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 
171 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.25617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  47.22 
 
 
147 aa  127  4e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 
148 aa  125  2e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 
148 aa  125  2e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.45753e-06  hitchhiker  1.02152e-13 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
167 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
160 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
147 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  44.59 
 
 
149 aa  121  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
151 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.25439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 
153 aa  119  1e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  44.22 
 
 
147 aa  119  1e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
149 aa  119  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  42.86 
 
 
148 aa  119  2e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.18 
 
 
147 aa  118  2e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
147 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  43.84 
 
 
148 aa  117  4e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  117  4e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
147 aa  117  5e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
179 aa  117  8e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  115  1e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.08464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
168 aa  115  2e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  115  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  42.47 
 
 
148 aa  115  2e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  43.06 
 
 
151 aa  115  2e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
149 aa  115  2e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
149 aa  115  2e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 
151 aa  114  4e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
149 aa  114  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
148 aa  113  8e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
149 aa  112  1e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  112  1e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  37.5 
 
 
149 aa  112  2e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  43.24 
 
 
149 aa  112  2e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
147 aa  112  2e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
148 aa  112  2e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
148 aa  112  2e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  41.22 
 
 
148 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  43.14 
 
 
168 aa  111  4e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
175 aa  111  4e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
148 aa  110  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  41.38 
 
 
148 aa  110  7e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  41.5 
 
 
149 aa  110  8e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 
189 aa  110  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 
152 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
148 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
146 aa  109  1e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  42.11 
 
 
151 aa  109  1e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
149 aa  109  1e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
194 aa  108  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
170 aa  108  2e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
149 aa  108  2e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  43.54 
 
 
146 aa  108  2e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
150 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  38.51 
 
 
149 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
181 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  47.45 
 
 
150 aa  107  4e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
149 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  45.26 
 
 
191 aa  107  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  39.74 
 
 
152 aa  106  9e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  39.86 
 
 
151 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  45.14 
 
 
147 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
165 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
150 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
149 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
209 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
189 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
148 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  41.22 
 
 
148 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
150 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  40.13 
 
 
193 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  39.19 
 
 
148 aa  104  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
168 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
150 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
150 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  42.57 
 
 
151 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  42.28 
 
 
150 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  45.27 
 
 
152 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 
209 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 
194 aa  103  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  43.15 
 
 
153 aa  103  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
146 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  40.27 
 
 
178 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>