More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2233 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  45.45 
 
 
287 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  44.9 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  37.32 
 
 
286 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  37.92 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  37.15 
 
 
285 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  37.15 
 
 
285 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  36.76 
 
 
285 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  40.78 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  38.6 
 
 
281 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5942  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.22 
 
 
252 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  32.73 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  37.18 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.14 
 
 
262 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.09 
 
 
265 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.96 
 
 
310 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2239  oxidoreductase  36.82 
 
 
264 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317079  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.4 
 
 
328 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  35.86 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  33.2 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  36 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  36.86 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1324  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.51 
 
 
261 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  38.53 
 
 
343 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  34.31 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.8 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
332 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4792  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.57 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  32.8 
 
 
310 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  29.75 
 
 
313 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  29.75 
 
 
313 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  34.68 
 
 
256 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.8 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  30.54 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0190  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.69 
 
 
264 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  29.14 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  30.72 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10043  oxidoreductase  35.18 
 
 
264 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  35.23 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0860  hypothetical protein  33.45 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2902  hypothetical protein  33.92 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0865199  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  36.23 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5381  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5470  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.229318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5757  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.631627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  32.46 
 
 
330 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  34.98 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0643  hypothetical protein  31.12 
 
 
258 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  34.11 
 
 
330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  34.17 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  35.19 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  34.12 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6045  hypothetical protein  31.88 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0597189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  32.84 
 
 
338 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  32.84 
 
 
338 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
288 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  34.93 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  32.46 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  35.71 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  35.71 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  34.14 
 
 
300 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  34.14 
 
 
300 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  35.71 
 
 
309 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  35.78 
 
 
330 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  39.37 
 
 
316 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  33.02 
 
 
347 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  34.67 
 
 
294 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  30.47 
 
 
332 aa  108  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  34.73 
 
 
309 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4922  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.48 
 
 
259 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.550602  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  39.59 
 
 
298 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  33.73 
 
 
300 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  32.73 
 
 
353 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  32.95 
 
 
309 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  34.86 
 
 
311 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  31.5 
 
 
307 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  30.39 
 
 
313 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  29.58 
 
 
290 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.06 
 
 
292 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.73 
 
 
310 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
306 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  31.08 
 
 
342 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.38 
 
 
287 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  30.42 
 
 
290 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
308 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 
288 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  33.58 
 
 
316 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  33.21 
 
 
296 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11520  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.88 
 
 
280 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  31.84 
 
 
288 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  35.68 
 
 
306 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  31.75 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  34.45 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  33.86 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  33.95 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  32.72 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>