30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0449 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  100 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  47.25 
 
 		 328 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  42.19 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  43.66 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  41.57 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  28.57 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  28.57 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  35.29 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  40.48 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  41.43 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  35.87 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  39.53 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  33.33 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  37.21 
 
 		 298 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  34.48 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  34.44 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  38.82 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  39.13 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  35.63 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  31.58 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  35.96 
 
 		 353 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  26.67 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  36.08 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  37.68 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  29.84 
 
 		 238 aa  45.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  32.93 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.82 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  25.83 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  31.88 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  27.71 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>