136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3352 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  100 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  50.33 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  49.35 
 
 		 324 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  49.02 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  48.87 
 
 		 312 aa  265  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  46.71 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  49.67 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  47.88 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  48.37 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  47.71 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  48.04 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  38.85 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  38.85 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  39.19 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.19 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  39.19 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  39.19 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  39.19 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  39.19 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  39.19 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  38.51 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  38.51 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  38.51 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  38.51 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  39.93 
 
 		 321 aa  215  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  39.19 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.92 
 
 		 320 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  39.53 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  37.92 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  36.82 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.92 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.82 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  36.52 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  36.23 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.97 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  31.21 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  30.91 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  31.21 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  31.54 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  32.47 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  34.47 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  33.23 
 
 		 320 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  31 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  22.91 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.96 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  22.55 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.18 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.55 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.97 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.97 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.76 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  22.55 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.29 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  26.06 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.28 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.04 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.66 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  23.18 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  24.76 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  24.86 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  24.86 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  24.79 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  24.86 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  26.52 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  25.27 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  24.32 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  24.32 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.76 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  24.27 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.34 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  22.3 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.34 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.34 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  24.84 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  25.24 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  23.24 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  24.92 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.18 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  23.9 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.19 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.36 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.43 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  21.84 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.24 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  25.45 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  25.45 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  22.69 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  23.4 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  24.57 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>