254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2024 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  99.55 
 
 
224 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  69.37 
 
 
223 aa  314  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  72.04 
 
 
223 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  71.43 
 
 
223 aa  297  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  70 
 
 
223 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  71.56 
 
 
223 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  71.56 
 
 
223 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  71.56 
 
 
223 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  71.56 
 
 
223 aa  293  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  71.56 
 
 
223 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  71.56 
 
 
223 aa  292  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  71.09 
 
 
223 aa  292  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  71.09 
 
 
223 aa  291  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  63.64 
 
 
220 aa  279  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  64.09 
 
 
223 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  65.26 
 
 
223 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  65.58 
 
 
223 aa  275  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  62.56 
 
 
226 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  61.93 
 
 
220 aa  262  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  61.36 
 
 
220 aa  261  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  61.36 
 
 
220 aa  261  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  61.93 
 
 
220 aa  262  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  60.55 
 
 
220 aa  261  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  58.82 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  57.53 
 
 
220 aa  252  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  58.99 
 
 
222 aa  250  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  60.66 
 
 
217 aa  248  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  59.15 
 
 
224 aa  248  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  57.4 
 
 
233 aa  248  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  61.79 
 
 
239 aa  242  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  55.02 
 
 
233 aa  241  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  56.22 
 
 
220 aa  240  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  59.52 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  55.76 
 
 
224 aa  237  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  57.89 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  57.21 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  57.48 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  57.82 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  56.16 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  55.76 
 
 
224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  53.12 
 
 
226 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  53.64 
 
 
220 aa  228  4e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  56.54 
 
 
238 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  57.21 
 
 
248 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  50.68 
 
 
228 aa  229  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  57.21 
 
 
248 aa  228  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  51.61 
 
 
219 aa  227  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  52.53 
 
 
260 aa  227  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  54.42 
 
 
216 aa  226  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  54.09 
 
 
222 aa  226  2e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  54.17 
 
 
221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  53.49 
 
 
224 aa  222  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  53.05 
 
 
249 aa  221  9e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  54.21 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  53.64 
 
 
409 aa  219  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  56.34 
 
 
212 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  52.8 
 
 
236 aa  218  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  50.47 
 
 
237 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  55.61 
 
 
241 aa  217  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  49.55 
 
 
222 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  55.35 
 
 
218 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  52.53 
 
 
227 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  54.75 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  52.34 
 
 
221 aa  211  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  52.13 
 
 
222 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  50.7 
 
 
220 aa  209  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  51.2 
 
 
217 aa  209  3e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  51.42 
 
 
222 aa  208  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  54.72 
 
 
223 aa  208  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  54.25 
 
 
223 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  54.25 
 
 
223 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  48.15 
 
 
248 aa  202  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  48.21 
 
 
222 aa  201  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  44.24 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  49.76 
 
 
215 aa  199  3e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  54.5 
 
 
226 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  47.69 
 
 
248 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  50.24 
 
 
231 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  48.8 
 
 
231 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6946  deoxyribose-phosphate aldolase  53.27 
 
 
226 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1543  deoxyribose-phosphate aldolase  53.27 
 
 
226 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6286  deoxyribose-phosphate aldolase  53.27 
 
 
226 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.576612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  43.24 
 
 
235 aa  192  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  51.43 
 
 
213 aa  193  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  48.83 
 
 
221 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  49.55 
 
 
240 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  50.23 
 
 
219 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  46.23 
 
 
229 aa  188  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  44.89 
 
 
223 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0114  deoxyribose-phosphate aldolase  43.98 
 
 
221 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  48.4 
 
 
236 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  45.12 
 
 
215 aa  184  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1560  deoxyribose-phosphate aldolase  46.48 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  48.17 
 
 
221 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  49.76 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  46.38 
 
 
226 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2321  deoxyribose-phosphate aldolase  46.67 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000020157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  44.93 
 
 
223 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  45.81 
 
 
238 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.789001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>