59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1417 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1025    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  97.37 
 
 		 495 aa  965    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  25 
 
 		 239 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  26.71 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  23.53 
 
 		 230 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  25.55 
 
 		 247 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  26.52 
 
 		 216 aa  53.9  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  24.2 
 
 		 277 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  22.57 
 
 		 368 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  25.41 
 
 		 570 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  24.64 
 
 		 217 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  26.74 
 
 		 216 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  26.74 
 
 		 216 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  23.86 
 
 		 388 aa  50.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  27.13 
 
 		 216 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  27.66 
 
 		 216 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  27.66 
 
 		 216 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  27.66 
 
 		 216 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  22.96 
 
 		 250 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  28.34 
 
 		 216 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  26.74 
 
 		 216 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  26.74 
 
 		 216 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  24.65 
 
 		 261 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  26.6 
 
 		 216 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  22.75 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  23.3 
 
 		 233 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  25.49 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  25.52 
 
 		 208 aa  49.3  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  25.49 
 
 		 215 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  26.62 
 
 		 191 aa  49.3  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  24.48 
 
 		 223 aa  48.5  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  24.64 
 
 		 208 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  21.47 
 
 		 267 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  25.49 
 
 		 212 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  21.67 
 
 		 271 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  23.53 
 
 		 362 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  21.78 
 
 		 230 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  21.78 
 
 		 230 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  20.87 
 
 		 368 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  23.97 
 
 		 247 aa  47.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  22.54 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  22.5 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  24.6 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  27.34 
 
 		 210 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  25.32 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  24.48 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  25.18 
 
 		 212 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  24.78 
 
 		 256 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  22.54 
 
 		 204 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  25.64 
 
 		 365 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  25.71 
 
 		 223 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  24.46 
 
 		 313 aa  43.5  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>