More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1255 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  97.98 
 
 		 445 aa  862    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  100 
 
 		 445 aa  882    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  43.57 
 
 		 450 aa  335  9e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  43.71 
 
 		 484 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  40.1 
 
 		 452 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  40.43 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  39.67 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  40.05 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  39.71 
 
 		 471 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  38.15 
 
 		 450 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  38.76 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  36.84 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  36.84 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  36.34 
 
 		 451 aa  295  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  36.07 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  37.23 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  36.12 
 
 		 542 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  37.7 
 
 		 461 aa  289  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.39 
 
 		 444 aa  289  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  37.91 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  38.68 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  36.67 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  36.45 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  38.05 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  37.18 
 
 		 481 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  40.43 
 
 		 470 aa  282  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  37.16 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  37.35 
 
 		 470 aa  280  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  35.32 
 
 		 480 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  35.32 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  35.32 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  38.52 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  38.86 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  36.23 
 
 		 479 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  36.58 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  34.84 
 
 		 480 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  38.52 
 
 		 471 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  35.5 
 
 		 462 aa  275  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  39.33 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  39 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  34.37 
 
 		 480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  34.84 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  38.61 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  34.37 
 
 		 480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  34.37 
 
 		 480 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  35.96 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  37.23 
 
 		 462 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  35.96 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  36.99 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  37.65 
 
 		 473 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  38.6 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  34.44 
 
 		 453 aa  267  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  36.73 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  34.84 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  34.44 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  34.44 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  34.45 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  36.86 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  34.44 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  34.44 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  34.29 
 
 		 491 aa  263  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  34.29 
 
 		 491 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  34.29 
 
 		 491 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  35.78 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  34.09 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  35.32 
 
 		 480 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  36.63 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  34.76 
 
 		 480 aa  260  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  32.44 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  34.09 
 
 		 459 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.66 
 
 		 454 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  34.92 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  34.88 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  34.92 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  34.92 
 
 		 454 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.59 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  34.68 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  35.45 
 
 		 422 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  32.81 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  34.5 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  31.93 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  39.23 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  30.88 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  32.44 
 
 		 454 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  34.61 
 
 		 477 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.41 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  36.27 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  35.48 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  36.21 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  34.9 
 
 		 455 aa  249  8e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  34.09 
 
 		 459 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  33.26 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  39.73 
 
 		 452 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  31 
 
 		 460 aa  247  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  33.49 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  36.69 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  34.29 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  33.95 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  34.96 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>