192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0879 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  95.24 
 
 
273 aa  490  1e-138  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  46.46 
 
 
267 aa  164  1e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  32.43 
 
 
237 aa  89.7  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  30.17 
 
 
292 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  30 
 
 
261 aa  77.8  2e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.81299e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  35.25 
 
 
280 aa  73.2  4e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 
278 aa  65.9  8e-10  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.80726e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  36.11 
 
 
220 aa  63.9  3e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.68416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  34.83 
 
 
210 aa  63.2  5e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  29.31 
 
 
196 aa  62  1e-08  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  34.69 
 
 
346 aa  61.2  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  33.33 
 
 
340 aa  60.8  2e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  35.24 
 
 
337 aa  60.5  3e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  30.83 
 
 
287 aa  60.1  3e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  26.38 
 
 
244 aa  60.5  3e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  30.68 
 
 
288 aa  59.7  5e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  2.78939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  34.83 
 
 
313 aa  59.3  6e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  35.96 
 
 
337 aa  59.3  7e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  26.55 
 
 
272 aa  58.9  8e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  30.39 
 
 
333 aa  58.5  1e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0685e-07 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  29.38 
 
 
193 aa  58.5  1e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 
337 aa  58.5  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  34.83 
 
 
313 aa  58.5  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  27.94 
 
 
269 aa  58.2  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  34.83 
 
 
337 aa  57.8  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  34.83 
 
 
337 aa  57.8  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  29.66 
 
 
396 aa  57.8  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  34.83 
 
 
337 aa  57.4  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  27.88 
 
 
256 aa  57.4  2e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 
221 aa  58.2  2e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  1.82048e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  34.83 
 
 
337 aa  57.8  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  25.93 
 
 
237 aa  57.8  2e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  26.11 
 
 
244 aa  57.8  2e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  27.14 
 
 
284 aa  57.4  3e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  38.75 
 
 
281 aa  57  3e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  32.38 
 
 
337 aa  57  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  40.95 
 
 
328 aa  56.6  4e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.58 
 
 
312 aa  56.2  5e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  30.68 
 
 
286 aa  56.2  5e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  2.01815e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  42.86 
 
 
775 aa  55.8  7e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  26 
 
 
308 aa  55.8  8e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 
282 aa  55.1  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  22.61 
 
 
249 aa  54.7  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 
284 aa  55.1  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 
284 aa  55.1  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  40.96 
 
 
284 aa  54.7  2e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.22 
 
 
297 aa  54.3  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  31.78 
 
 
282 aa  54.3  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 
291 aa  54.3  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 
284 aa  54.7  2e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 
284 aa  53.9  3e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  22.48 
 
 
253 aa  53.1  4e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.43871e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  26.18 
 
 
225 aa  53.5  4e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.37963e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  24.76 
 
 
244 aa  53.5  4e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.54218e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  32.89 
 
 
280 aa  52.8  5e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  27.78 
 
 
227 aa  53.1  5e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.21988e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  22.11 
 
 
249 aa  52.8  6e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.81046e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  24.36 
 
 
235 aa  52.4  7e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  22.11 
 
 
249 aa  52.8  7e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  22.11 
 
 
249 aa  52.8  7e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  9.28453e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  22.11 
 
 
249 aa  52.4  8e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.50498e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  30.68 
 
 
211 aa  52.4  8e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  36.36 
 
 
251 aa  52.4  8e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  22.11 
 
 
235 aa  52  9e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.59802e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  25.76 
 
 
289 aa  52.4  9e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  37.08 
 
 
193 aa  52.4  9e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
237 aa  51.6  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
237 aa  51.6  1e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  29.91 
 
 
284 aa  51.6  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  32.18 
 
 
288 aa  52  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
227 aa  51.6  1e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  28.97 
 
 
282 aa  52  1e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  32.95 
 
 
267 aa  52  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  33.72 
 
 
130 aa  51.6  1e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  36.59 
 
 
527 aa  51.2  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
292 aa  50.8  2e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.50846e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  36.59 
 
 
527 aa  51.2  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  30.82 
 
 
278 aa  51.2  2e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  2.33024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  33.73 
 
 
241 aa  51.6  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  29.01 
 
 
237 aa  50.4  3e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  36.07 
 
 
211 aa  50.4  3e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  36.07 
 
 
211 aa  50.4  3e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  28.7 
 
 
238 aa  50.4  3e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  28.18 
 
 
282 aa  50.1  4e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  32.97 
 
 
192 aa  50.1  4e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  33.01 
 
 
225 aa  50.1  4e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  28.65 
 
 
286 aa  49.7  5e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  33.01 
 
 
203 aa  49.7  5e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  31.18 
 
 
528 aa  49.7  5e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  34.21 
 
 
362 aa  49.3  6e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.4849e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  33.04 
 
 
248 aa  49.3  6e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  30.19 
 
 
251 aa  49.7  6e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1134  abortive infection protein  28.18 
 
 
197 aa  49.3  7e-05  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  2.23923e-08 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  24.3 
 
 
249 aa  48.9  8e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.9132e-08  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  35 
 
 
237 aa  48.9  9e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.95841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  24.85 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  39.24 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  31.65 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  24 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>