242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2003 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  99.66 
 
 
294 aa  584  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  50.17 
 
 
294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  49.66 
 
 
293 aa  291  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  46.94 
 
 
292 aa  285  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  46.94 
 
 
290 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  44.07 
 
 
289 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  41.84 
 
 
293 aa  247  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  42.71 
 
 
292 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  41.02 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  39.8 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  41.95 
 
 
291 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  39.8 
 
 
292 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  42.86 
 
 
291 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  41.84 
 
 
291 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  41.84 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  41.84 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  41.84 
 
 
291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  41.84 
 
 
291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  41.84 
 
 
291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  41.84 
 
 
291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  41.84 
 
 
291 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  41.5 
 
 
291 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  40.82 
 
 
292 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  42.03 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  42.86 
 
 
291 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  41.89 
 
 
291 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  39.12 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  38.64 
 
 
292 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  37.07 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  38.38 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  38.38 
 
 
292 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  38.31 
 
 
292 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  36.39 
 
 
292 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  39.32 
 
 
293 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  36.73 
 
 
288 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  35.93 
 
 
291 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  36.05 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  35.93 
 
 
291 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  37.07 
 
 
291 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  35.59 
 
 
292 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  36.15 
 
 
288 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  34.81 
 
 
293 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  35.93 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  35.03 
 
 
292 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  36.73 
 
 
288 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  35.93 
 
 
300 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  35.93 
 
 
300 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  37.07 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  35.12 
 
 
287 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  35.25 
 
 
288 aa  175  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  34.01 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  34.35 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  37.29 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  34.68 
 
 
309 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  34.46 
 
 
288 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  31.99 
 
 
293 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  35.14 
 
 
289 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  31.97 
 
 
287 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  30.72 
 
 
297 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  31.97 
 
 
287 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  32.99 
 
 
287 aa  168  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  35.67 
 
 
291 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  35.45 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  33.45 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  35.02 
 
 
287 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  34.69 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  32.99 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  33.54 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  35.05 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  33.02 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  33.02 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  33.02 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  35.25 
 
 
286 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  32.7 
 
 
307 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  32.7 
 
 
307 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  34.68 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  34.68 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  34.34 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  32.7 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  34.78 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  32.31 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  32.65 
 
 
288 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  32.65 
 
 
287 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  33 
 
 
287 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  34.31 
 
 
302 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>