235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01150 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  100 
 
 
547 aa  1129    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  50.37 
 
 
517 aa  505  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  49.91 
 
 
511 aa  502  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  43.32 
 
 
460 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  43.26 
 
 
461 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  42.4 
 
 
461 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  42.38 
 
 
504 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  41.57 
 
 
461 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  42.02 
 
 
460 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  42.8 
 
 
474 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  43.89 
 
 
458 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  42.72 
 
 
469 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  44.07 
 
 
471 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  43.48 
 
 
458 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  42.52 
 
 
465 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  40.51 
 
 
463 aa  359  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  41.36 
 
 
469 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  41.55 
 
 
469 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  44.42 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  42.35 
 
 
469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  41.55 
 
 
469 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  42.35 
 
 
461 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  41.55 
 
 
469 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  41.17 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  40.04 
 
 
465 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  41.36 
 
 
469 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  41.17 
 
 
469 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  41.89 
 
 
471 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  40.88 
 
 
470 aa  350  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  41.2 
 
 
468 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  42.5 
 
 
467 aa  349  9e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  42.71 
 
 
469 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  40.15 
 
 
470 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  40.56 
 
 
470 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  40.76 
 
 
470 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  43.01 
 
 
466 aa  343  5.999999999999999e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  41.08 
 
 
471 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  39.06 
 
 
463 aa  340  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  39.06 
 
 
463 aa  340  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  40.95 
 
 
470 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  40.36 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  39.73 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  40.34 
 
 
465 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  40.35 
 
 
460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  40.65 
 
 
465 aa  332  8e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  40.46 
 
 
465 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  39.73 
 
 
471 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  38.8 
 
 
463 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  40.31 
 
 
476 aa  329  6e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  39.2 
 
 
472 aa  329  6e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  40.96 
 
 
453 aa  330  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  41.13 
 
 
462 aa  329  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  40.78 
 
 
473 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  39.18 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  40.33 
 
 
472 aa  326  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  39.45 
 
 
473 aa  325  9e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  38.99 
 
 
461 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  40.42 
 
 
463 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  38.61 
 
 
471 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  38.78 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  37.52 
 
 
516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  38.85 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  38.33 
 
 
466 aa  321  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  38.26 
 
 
476 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  37.43 
 
 
475 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  40.71 
 
 
472 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  38.04 
 
 
472 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  37.92 
 
 
475 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  38.91 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  37.6 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  37.91 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  38.21 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  40.21 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  38.04 
 
 
499 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  40.08 
 
 
472 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  37.6 
 
 
476 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  37.6 
 
 
476 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  40.08 
 
 
472 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  37.52 
 
 
475 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  37.86 
 
 
476 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  37.66 
 
 
465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  37.48 
 
 
481 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  38.84 
 
 
435 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  37.38 
 
 
475 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  37.88 
 
 
477 aa  297  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  35.22 
 
 
497 aa  297  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  34.68 
 
 
499 aa  296  9e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  36.35 
 
 
480 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  38.8 
 
 
467 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  36.02 
 
 
483 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  36.6 
 
 
482 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  35.79 
 
 
475 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  35.79 
 
 
475 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  34.5 
 
 
500 aa  291  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  35.08 
 
 
483 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  36.61 
 
 
498 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  35.08 
 
 
483 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  35.08 
 
 
483 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  36.35 
 
 
483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  36.9 
 
 
480 aa  286  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>