More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1686 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1857  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
130 aa  256  9e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1686  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
130 aa  256  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2063  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
130 aa  256  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0077  50S ribosomal protein L15  88.46 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.298672  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1015  50S ribosomal protein L15  82.95 
 
 
133 aa  213  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0038652  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1758  50S ribosomal protein L15  82.03 
 
 
133 aa  209  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0357402  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0102  50S ribosomal protein L15  81.4 
 
 
133 aa  207  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0052  50S ribosomal protein L15  78.12 
 
 
133 aa  201  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.712422  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1950  ribosomal protein L15  73.23 
 
 
134 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0304  50S ribosomal protein L15  70.08 
 
 
132 aa  186  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.888542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  47.93 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  48.15 
 
 
147 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 
146 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 
146 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  46.03 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 
144 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  40.32 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  48.6 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  46.3 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  49.07 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 
144 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  48.15 
 
 
146 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  44.04 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  48.62 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3160  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  48.62 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2931  50S ribosomal protein L15  43.08 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484025 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  45.79 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  48.62 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3278  50S ribosomal protein L15  42.31 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1219  hitchhiker  0.000182201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  65.62 
 
 
144 aa  84.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  40.62 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  44.14 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  42.45 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  44.04 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2150  ribosomal protein L15  46.73 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0266224  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3000  50S ribosomal protein L15  45.61 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0225964  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3930  50S ribosomal protein L15  46.23 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  43.12 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  45.1 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  42.97 
 
 
144 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  43.86 
 
 
143 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000022076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  43.86 
 
 
143 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  43.52 
 
 
144 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  45.37 
 
 
146 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  43.52 
 
 
144 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  43.52 
 
 
144 aa  84  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0620  50S ribosomal protein L15  41.6 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.163377  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  52.87 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  42.34 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5051  50S ribosomal protein L15  45.28 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  47.71 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  48.04 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0494  50S ribosomal protein L15P  40.65 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  44.44 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0339  ribosomal protein L15  40.83 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126422  hitchhiker  0.00264264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1041  50S ribosomal protein L15  48.6 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140448  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  41.82 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000332243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0400  50S ribosomal protein L15  45.28 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  41.82 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  42.75 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000785215  unclonable  0.00000000000230267 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0219  50S ribosomal protein L15  41.82 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000749249  hitchhiker  0.000103744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  42.2 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0392  50S ribosomal protein L15  45.28 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0068073  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  41.82 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4037  50S ribosomal protein L15  41.82 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000806157  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  43.52 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  44.25 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  60.94 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0342  50S ribosomal protein L15  62.5 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00281709  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  45.37 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  63.08 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  43.52 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  44.14 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0218  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000450664  unclonable  0.0000000000146358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0213  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00106088  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0218  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000246437  hitchhiker  0.00000000104256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>