86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0344 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0344  beta-lactamase  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1383  conserved hypothetical protein, possible beta-lactamase  52 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3016  Beta-lactamase  39.36 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8961  Beta-lactamase  38.46 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72760  putative beta-lactamase  37.97 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2220  beta-lactamase  37.93 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6316  beta-lactamase PSE-2  38.64 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2477  Beta-lactamase  40.09 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0951  Beta-lactamase  38.81 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4075  Beta-lactamase  35.59 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.709144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3962  Beta-lactamase  35.59 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3440  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.71 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0694  Beta-lactamase  36.71 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000596311  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0907  Beta-lactamase  35.02 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.175545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2040  Beta-lactamase  33.91 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3328  Beta-lactamase  36.29 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.306621  normal  0.885767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0837  beta-lactamase, putative  33.33 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5028  Beta-lactamase (OXA-5), class D  32.91 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0412  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.05 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2340  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0669803  normal  0.380486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3157  Beta-lactamase  35.81 
 
 		 270 aa  131  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3398  Beta-lactamase  31.9 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.130069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3220  Beta-lactamase  35.68 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0828246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0813  Beta-lactamase  35.4 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00568131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0120  Beta-lactamase  32.2 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0845  Beta-lactamase  35.4 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.965986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0838  Beta-lactamase  35.4 
 
 		 295 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000482216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3124  Beta-lactamase  32.33 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3522  Beta-lactamase  35.4 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3505  Beta-lactamase  32.79 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2637  Beta-lactamase  34.75 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.578583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0424  Beta-lactamase  33.06 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1050  Beta-lactamase  36.28 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1109  Beta-lactamase  34.08 
 
 		 261 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1887  beta-lactamase class D  37.38 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131226  normal  0.0179427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1276  Beta-lactamase  33.91 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1596  Beta-lactamase  31.38 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2332  Beta-lactamase  32.63 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428372  normal  0.506587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0427  Beta-lactamase  30.67 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1435  Beta-lactamase  33.33 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3353  Beta-lactamase  33.62 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0483  putative beta-lactamase  33.64 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  33.33 
 
 		 596 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  30.34 
 
 		 585 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  30.34 
 
 		 585 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  30.34 
 
 		 585 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0301  Beta-lactamase  31.84 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000029774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1588  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1405  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  30.96 
 
 		 585 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  30.39 
 
 		 405 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0077  hypothetical protein  26.77 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  hitchhiker  0.00231876  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  30.54 
 
 		 585 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  31 
 
 		 585 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3930  Beta-lactamase  26.61 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.204659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3817  Beta-lactamase  26.61 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0211  Beta-lactamase  29.61 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1053  beta-lactamase class D  27.66 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0389  Beta-lactamase  25.67 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384736 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2719  class D beta-lactamase  28.21 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886076  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0373  beta-lactamase precursor  24.9 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2872  class D beta-lactamase  28.21 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1441  Beta-lactamase  28.88 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1106  class D beta-lactamase  28.21 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0184  Beta-lactamase  28.51 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02005  oxacillin hydrolase  25 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4544  Beta-lactamase  23.81 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2849  Beta-lactamase  24.23 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4788  Beta-lactamase  24.57 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4137  Beta-lactamase  24.57 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3379  Beta-lactamase  24.57 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.27 
 
 		 761 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  31.91 
 
 		 646 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  29.08 
 
 		 602 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 681 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  27.78 
 
 		 647 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 701 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 		 553 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  25.47 
 
 		 609 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 633 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 648 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 648 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 		 478 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 		 640 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 648 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  29.41 
 
 		 634 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>