More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0042 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0081  flagellar hook protein  99.82 
 
 
545 aa  1084  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0058  flagellar hook protein  97.06 
 
 
545 aa  1057  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0042  flagellar hook protein  100 
 
 
545 aa  1085  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1520  flagellar hook protein FlgE  53.76 
 
 
541 aa  563  1e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0008  flagellar hook protein  36.64 
 
 
546 aa  337  3e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2290  fagellar hook-basal body protein  35.36 
 
 
567 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2049  hypothetical protein  36.25 
 
 
533 aa  272  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.45 
 
 
488 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.13 
 
 
508 aa  146  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  26.84 
 
 
479 aa  143  1e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  27.35 
 
 
519 aa  142  2e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.89081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.36 
 
 
462 aa  128  2e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  35.15 
 
 
770 aa  110  7e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.03 
 
 
264 aa  104  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  33.74 
 
 
705 aa  103  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 
390 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  43.48 
 
 
264 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  40.14 
 
 
819 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.92 
 
 
397 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0031  hypothetical protein  34.76 
 
 
430 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  43.66 
 
 
275 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.96 
 
 
501 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  25.09 
 
 
464 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  41.94 
 
 
266 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.02789e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  33.64 
 
 
718 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  40.15 
 
 
265 aa  100  5e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  34.95 
 
 
403 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  29.27 
 
 
911 aa  100  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  34.95 
 
 
403 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.85 
 
 
513 aa  100  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  38.97 
 
 
498 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
394 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  39.04 
 
 
851 aa  99.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.69 
 
 
261 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  41.73 
 
 
814 aa  99  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  39.42 
 
 
262 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  29.89 
 
 
441 aa  99.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.97 
 
 
636 aa  98.2  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  34.41 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  34.41 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  34.41 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  33.18 
 
 
398 aa  98.2  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  40.31 
 
 
702 aa  97.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  30.34 
 
 
404 aa  97.8  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  42.19 
 
 
409 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  33.33 
 
 
750 aa  97.1  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  40 
 
 
442 aa  97.1  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  32.51 
 
 
440 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  9.0236e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.44 
 
 
454 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  38.4 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  29.43 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.1 
 
 
499 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  34.41 
 
 
401 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  31.07 
 
 
401 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  34.41 
 
 
401 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.5 
 
 
270 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  37.31 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  37.31 
 
 
401 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  34.41 
 
 
401 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  37.31 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  37.31 
 
 
402 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  42.11 
 
 
262 aa  94.4  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  37.31 
 
 
402 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  32.39 
 
 
875 aa  94.4  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.86 
 
 
525 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  38.69 
 
 
262 aa  94  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  37.98 
 
 
404 aa  93.6  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  40.16 
 
 
407 aa  93.6  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.13 
 
 
265 aa  93.6  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.48 
 
 
423 aa  93.6  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  32.65 
 
 
428 aa  93.2  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  32.65 
 
 
428 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 
410 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.35 
 
 
266 aa  93.2  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.94 
 
 
808 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  32.65 
 
 
428 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  40 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  31.67 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.99 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  33.15 
 
 
282 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  38.62 
 
 
260 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3444  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.94 
 
 
569 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  37.68 
 
 
266 aa  92.8  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
395 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  38.62 
 
 
260 aa  92.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  38.56 
 
 
845 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  30.34 
 
 
395 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  39.86 
 
 
838 aa  92  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  44 
 
 
413 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  30.29 
 
 
407 aa  91.3  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  37.23 
 
 
262 aa  91.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  37.23 
 
 
262 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  39.31 
 
 
261 aa  90.9  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  39.42 
 
 
262 aa  90.9  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  37.59 
 
 
262 aa  90.9  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  37.23 
 
 
262 aa  90.9  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  36.96 
 
 
260 aa  90.9  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  41.09 
 
 
425 aa  90.5  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  40.14 
 
 
310 aa  90.5  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  41.13 
 
 
265 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>