More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0012 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  56.91 
 
 
613 aa  658  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  60.14 
 
 
554 aa  660  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  57.96 
 
 
557 aa  658  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  68.63 
 
 
561 aa  788  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  2.40463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  77.16 
 
 
557 aa  876  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  67.81 
 
 
560 aa  756  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  67.81 
 
 
560 aa  756  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  56.91 
 
 
558 aa  658  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  56.53 
 
 
557 aa  645  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  59.64 
 
 
557 aa  684  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  59.64 
 
 
557 aa  684  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  59.64 
 
 
557 aa  686  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  60.18 
 
 
557 aa  689  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  69.95 
 
 
562 aa  809  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  67.81 
 
 
560 aa  759  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  59.82 
 
 
557 aa  687  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  59.82 
 
 
557 aa  687  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  57.73 
 
 
558 aa  649  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  86.2 
 
 
558 aa  1003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  74.05 
 
 
559 aa  859  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  60 
 
 
557 aa  687  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  65.3 
 
 
561 aa  741  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  98.21 
 
 
558 aa  1113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
558 aa  1133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  58.96 
 
 
557 aa  685  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  76.26 
 
 
553 aa  860  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  57.63 
 
 
559 aa  666  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  59.82 
 
 
557 aa  687  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  59.64 
 
 
557 aa  686  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  59.82 
 
 
557 aa  684  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  76.44 
 
 
582 aa  868  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  58.96 
 
 
558 aa  678  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  77.52 
 
 
557 aa  877  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  97.85 
 
 
558 aa  1113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  53.38 
 
 
561 aa  615  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  55.18 
 
 
562 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  53.93 
 
 
562 aa  605  1e-172  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  53.93 
 
 
562 aa  605  1e-172  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  54.84 
 
 
565 aa  607  1e-172  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  53.23 
 
 
559 aa  602  1e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  53.76 
 
 
565 aa  603  1e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  52.87 
 
 
569 aa  601  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  53.58 
 
 
580 aa  600  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  53.94 
 
 
565 aa  601  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  52.87 
 
 
566 aa  595  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  53.61 
 
 
577 aa  585  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  53.31 
 
 
579 aa  582  1e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  53.41 
 
 
565 aa  575  1e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
552 aa  558  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 
554 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 
554 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0418  dihydroxyacid dehydratase  47.47 
 
 
617 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0213625  decreased coverage  0.00250401 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
556 aa  552  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 
552 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 
558 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  52.71 
 
 
559 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  49.01 
 
 
552 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 
560 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002038  dihydroxy-acid dehydratase  48.76 
 
 
613 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
554 aa  542  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
554 aa  539  1e-152  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  49.07 
 
 
599 aa  538  1e-152  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3508  dihydroxy-acid dehydratase  47.29 
 
 
616 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  48.02 
 
 
553 aa  537  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
552 aa  533  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3384  dihydroxy-acid dehydratase  46.33 
 
 
619 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137798 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4135  dihydroxy-acid dehydratase  46.33 
 
 
619 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0713209  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  46.56 
 
 
616 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4452  dihydroxy-acid dehydratase  46.17 
 
 
619 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.941603 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0485  dihydroxy-acid dehydratase  46.56 
 
 
616 aa  528  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.543148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2694  dihydroxy-acid dehydratase  47.31 
 
 
619 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0626  dihydroxy-acid dehydratase  47.7 
 
 
619 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546913  normal  0.890987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1899  dihydroxy-acid dehydratase  46.82 
 
 
619 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18498  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2305  dihydroxy-acid dehydratase  47.31 
 
 
619 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270143  hitchhiker  3.64232e-08 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  46.49 
 
 
619 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.189174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4231  dihydroxy-acid dehydratase  46.33 
 
 
619 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  47.19 
 
 
612 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4027  dihydroxy-acid dehydratase  46.08 
 
 
619 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.428088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  46.72 
 
 
612 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  46.56 
 
 
616 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5037  dihydroxy-acid dehydratase  46.82 
 
 
619 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.533366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  47.13 
 
 
616 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  48.57 
 
 
557 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1189  dihydroxy-acid dehydratase  46.64 
 
 
619 aa  525  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1784  dihydroxy-acid dehydratase  46.88 
 
 
615 aa  528  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4235  dihydroxy-acid dehydratase  46.96 
 
 
616 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.866608  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04630  dihydroxy-acid dehydratase  47.19 
 
 
612 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4129  dihydroxy-acid dehydratase  46.96 
 
 
616 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4294  dihydroxy-acid dehydratase  46.8 
 
 
616 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3546  dihydroxy-acid dehydratase  46.08 
 
 
619 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108366  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0292  dihydroxy-acid dehydratase  46.39 
 
 
616 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0079  dihydroxy-acid dehydratase  45.95 
 
 
610 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3988  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 
616 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 
616 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0066  dihydroxy-acid dehydratase  45.95 
 
 
610 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 
616 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2717  dihydroxy-acid dehydratase  46.64 
 
 
617 aa  525  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52758  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  47.49 
 
 
557 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.99143e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 
616 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  46.49 
 
 
618 aa  525  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>