More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1212 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  44.1 
 
 
196 aa  185  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  43.01 
 
 
204 aa  165  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  40.1 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  40.72 
 
 
196 aa  141  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  39.8 
 
 
195 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  33.82 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  38.35 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  39.39 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  40.11 
 
 
209 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  36.36 
 
 
194 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  34.33 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  35.12 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  32.86 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.13 
 
 
181 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  41.1 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  33.66 
 
 
226 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  29.41 
 
 
212 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  32.38 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  33.33 
 
 
209 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  30.77 
 
 
213 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 
212 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  29.95 
 
 
212 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  31.31 
 
 
203 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  31.82 
 
 
203 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  31.68 
 
 
204 aa  101  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  31.82 
 
 
203 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  31.19 
 
 
214 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  31.34 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  34.12 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  31.92 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  26.67 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  30 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  30.57 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  34.15 
 
 
227 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  32.43 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  29.41 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  28.64 
 
 
216 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  33.67 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  30.1 
 
 
206 aa  92  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.16 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  30.14 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  30.81 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  27.92 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  26.73 
 
 
221 aa  89.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  30.81 
 
 
202 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  28.22 
 
 
220 aa  87.8  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  31.84 
 
 
371 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  28.23 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  33.13 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  32.86 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  28.12 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  33.13 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  37.4 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  27.98 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  33.5 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  29.14 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  28.3 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  25.73 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  29.27 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  31.31 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  29.19 
 
 
218 aa  82  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  34.93 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.1 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  27.78 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  25.36 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  33.33 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  27.36 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.46 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  28.64 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  25.37 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.12 
 
 
365 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  29.03 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  25.29 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  26.22 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  31.33 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  29.61 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  26.7 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  27.6 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  28.78 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  27.6 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1877  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  30.05 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  29.63 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  28.16 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  26.74 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  30.69 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  27.05 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  26.85 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  26.57 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.57 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  26.47 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  25.7 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  26.47 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  29.67 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  36.27 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  26.26 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  28.5 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  32.03 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  28.68 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>