More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0095 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0095  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
76 aa  144  4e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.713288  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2070  50S ribosomal protein L24  80.82 
 
 
77 aa  117  5e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.419716  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1693  50S ribosomal protein L24  82.19 
 
 
77 aa  117  5e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0105327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1864  50S ribosomal protein L24  82.19 
 
 
77 aa  117  5e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1766  50S ribosomal protein L24  79.73 
 
 
78 aa  116  1e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  9.67663e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0045  50S ribosomal protein L24  77.03 
 
 
77 aa  115  2e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.74317  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1022  50S ribosomal protein L24  80.82 
 
 
78 aa  112  2e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000323194  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0070  50S ribosomal protein L24  80 
 
 
75 aa  110  7e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.033879  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1957  ribosomal protein L24  74.67 
 
 
78 aa  108  2e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0297  50S ribosomal protein L24  69.74 
 
 
76 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00211526  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  52.7 
 
 
106 aa  87.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.32884e-06  hitchhiker  1.26153e-07 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  54.67 
 
 
106 aa  82.8  2e-15  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  52 
 
 
105 aa  79  2e-14  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.01536e-07  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  49.28 
 
 
118 aa  78.6  3e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  78.2  3e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  5.30898e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09018e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.11062e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.27512e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.45325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.77787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.36575e-10  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  4e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.03774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
103 aa  77.8  5e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.83187e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
105 aa  77  7e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
105 aa  77  7e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
104 aa  77.4  7e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  47.83 
 
 
80 aa  77  8e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.23735e-08  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  53.42 
 
 
112 aa  77  8e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
103 aa  76.3  1e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.84056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
106 aa  76.6  1e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 
103 aa  75.5  2e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 
103 aa  76.3  2e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 
80 aa  75.1  3e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  5.67909e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  45.33 
 
 
106 aa  75.1  3e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  52.11 
 
 
108 aa  74.3  5e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  73.6  8e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  49.33 
 
 
105 aa  73.6  9e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
80 aa  73.2  1e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 
80 aa  73.2  1e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  47.89 
 
 
104 aa  72.8  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  49.3 
 
 
109 aa  72.4  2e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  47.3 
 
 
106 aa  72.4  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.32797e-05  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  54.67 
 
 
105 aa  72.8  2e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.60911e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  49.32 
 
 
107 aa  72.4  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  52.63 
 
 
107 aa  71.6  3e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  47.3 
 
 
106 aa  72  3e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  47.22 
 
 
109 aa  71.2  5e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.97674e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  46.58 
 
 
105 aa  70.9  6e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
80 aa  70.5  7e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.49977e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  48.57 
 
 
113 aa  70.5  8e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  52.11 
 
 
112 aa  70.5  8e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  50 
 
 
100 aa  70.5  8e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
107 aa  69.7  1e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  49.32 
 
 
106 aa  69.3  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.70602e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 
110 aa  69.7  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  2.98754e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
108 aa  69.7  1e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
107 aa  69.7  1e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  48.68 
 
 
112 aa  69.7  1e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  45.21 
 
 
115 aa  69.3  2e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
106 aa  69.3  2e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0290  50S ribosomal protein L24  58.57 
 
 
105 aa  68.9  2e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.94802e-08  hitchhiker  1.84934e-06 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
108 aa  69.3  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
109 aa  68.9  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  1.54774e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  46.48 
 
 
106 aa  68.9  2e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  50.7 
 
 
103 aa  69.3  2e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 
80 aa  68.6  3e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  44.59 
 
 
105 aa  68.2  3e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  7.17269e-06 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 
80 aa  68.2  3e-11  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  46.48 
 
 
105 aa  67.8  5e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  46.58 
 
 
115 aa  67.8  5e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0500  50S ribosomal protein L24  50.7 
 
 
101 aa  67.8  5e-11  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 
107 aa  67.4  6e-11  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.72359e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 
107 aa  67.4  6e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  43.66 
 
 
115 aa  67  7e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
107 aa  67  7e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
101 aa  67  8e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  4.985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  46.67 
 
 
104 aa  67  8e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
101 aa  67  8e-11  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.23185e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
102 aa  67  9e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.19742e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  39.44 
 
 
110 aa  67  9e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0925  KOW domain protein  51.43 
 
 
75 aa  67  9e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  6.00412e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  43.66 
 
 
106 aa  66.6  1e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  49.3 
 
 
106 aa  66.6  1e-10  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
101 aa  66.6  1e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  43.66 
 
 
118 aa  66.6  1e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 
118 aa  65.9  2e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  49.3 
 
 
122 aa  65.9  2e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.69052e-11  hitchhiker  1.15674e-08 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  43.66 
 
 
118 aa  65.5  2e-10  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 
105 aa  65.5  2e-10  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 
116 aa  65.5  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.40948e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  40 
 
 
128 aa  65.1  3e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 
105 aa  65.1  3e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  7.60345e-07  unclonable  2.81859e-10 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  46.48 
 
 
119 aa  65.1  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  49.3 
 
 
89 aa  64.7  4e-10  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  1.25199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2828  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 
102 aa  64.7  4e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000539429  normal  0.361907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  46.48 
 
 
110 aa  64.7  4e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0061  50S ribosomal protein L24  52.63 
 
 
102 aa  64.7  4e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  7.62997e-10  hitchhiker  1.34485e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>