More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0070 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0070  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 75 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.033879  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1864  50S ribosomal protein L24  85.33 
 
 		 77 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1693  50S ribosomal protein L24  85.33 
 
 		 77 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0105327  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2070  50S ribosomal protein L24  84 
 
 		 77 aa  123  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.419716  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0095  50S ribosomal protein L24  80 
 
 		 76 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.713288  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1766  50S ribosomal protein L24  73.61 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000967663  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1022  50S ribosomal protein L24  69.33 
 
 		 78 aa  107  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000323194  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0045  50S ribosomal protein L24  76.39 
 
 		 77 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.74317  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1957  ribosomal protein L24  71.83 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0297  50S ribosomal protein L24  64.79 
 
 		 76 aa  95.5  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00211526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  56.16 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  53.62 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  54.93 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  54.79 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  53.62 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  56.34 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  54.93 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  49.32 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  53.03 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  53.52 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  46.48 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  50 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0925  KOW domain protein  50.67 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000600412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  49.3 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  52.94 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  52.11 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  56.72 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  47.95 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  51.47 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  49.3 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  46.38 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  46.58 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  43.48 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  46.38 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>