59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1746 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  100 
 
 		 329 aa  674    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  62.77 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  60 
 
 		 349 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  59.69 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  59.69 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  58.77 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  58.28 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  58.05 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  51.07 
 
 		 327 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  48.93 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  40.74 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  40.72 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  37.21 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  40.58 
 
 		 335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  38.04 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  38.2 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  39.23 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  39.23 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  39.26 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  39.16 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  38.86 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  38.74 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  36.9 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  37.21 
 
 		 355 aa  205  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  35.94 
 
 		 347 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  39.46 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  38.08 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  38.73 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  38.92 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  36.53 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  37.95 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  38.28 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  38.51 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  35.48 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32.85 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  38.58 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  35.98 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  39.11 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  37.55 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  38.71 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  39.53 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  37.3 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.68 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.87 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0710  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.27 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  25 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3579  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.63 
 
 		 370 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.93999  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0680  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.05 
 
 		 352 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0829  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.05 
 
 		 352 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0242691  normal  0.504253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1976  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0088  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.91 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0120673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2564  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  25.76 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2244  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.98 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  37.14 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6071  Argininosuccinate synthase  37.14 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1894  argininosuccinate synthase  35.62 
 
 		 402 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1887  argininosuccinate synthase  35.62 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116306  normal  0.0366285 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  33.33 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0851  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  24.6 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.273783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>