More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11253 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  100 
 
 		 326 aa  670    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  68.83 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 323 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  64.52 
 
 		 315 aa  417  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  65.06 
 
 		 327 aa  414  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  63.23 
 
 		 320 aa  415  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  64.13 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  62.78 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  59.03 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  60.51 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  56.59 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  55.1 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  52.29 
 
 		 460 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  53.97 
 
 		 314 aa  344  8.999999999999999e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  51.96 
 
 		 314 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  51.96 
 
 		 314 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  53.8 
 
 		 319 aa  341  8e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  53.16 
 
 		 319 aa  340  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  54.49 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  50 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  51.75 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 319 aa  335  9e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  48.62 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 318 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  53.14 
 
 		 319 aa  331  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  55.87 
 
 		 318 aa  331  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.65 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  52.94 
 
 		 348 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  53.77 
 
 		 317 aa  329  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  51.48 
 
 		 311 aa  328  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  53.18 
 
 		 319 aa  328  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.32 
 
 		 311 aa  328  9e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  48.3 
 
 		 330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  51.97 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  50.78 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  50.94 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  52.19 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 317 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 319 aa  325  7e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 321 aa  325  7e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 317 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  49.21 
 
 		 333 aa  325  8.000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  52.4 
 
 		 352 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  52.56 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  52.56 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  52.29 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  51.8 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  53.82 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  54.46 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  52.72 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 316 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  49.36 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  51.88 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  53 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  51.92 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  51.53 
 
 		 461 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  51.53 
 
 		 461 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  50.79 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  52.68 
 
 		 333 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  48.11 
 
 		 324 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  50.79 
 
 		 320 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  51.71 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  49.2 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  52.41 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  51.69 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  51.42 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  52.2 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  52.2 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  52.2 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  52.2 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  52.2 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  52.24 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  51.91 
 
 		 316 aa  319  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  52.24 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  51.59 
 
 		 316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  49.38 
 
 		 458 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 340 aa  318  6e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  50.62 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  51.28 
 
 		 316 aa  318  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  50.78 
 
 		 317 aa  318  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.26 
 
 		 321 aa  318  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 321 aa  318  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  51.26 
 
 		 321 aa  318  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 321 aa  318  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 321 aa  318  7e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 321 aa  318  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  52.35 
 
 		 319 aa  318  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 321 aa  318  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>