More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0793 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  100 
 
 
332 aa  682  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  100 
 
 
343 aa  709  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  59.94 
 
 
323 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  58.05 
 
 
330 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  64.13 
 
 
274 aa  362  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  62.89 
 
 
157 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 
333 aa  179  5e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  37.46 
 
 
321 aa  179  5e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  37.46 
 
 
321 aa  179  5e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  38.03 
 
 
323 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  38.03 
 
 
463 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  38.11 
 
 
323 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  38.19 
 
 
323 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  38.02 
 
 
329 aa  174  2e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  37.7 
 
 
323 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  35.62 
 
 
321 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  35.29 
 
 
325 aa  162  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  35.29 
 
 
325 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  34.45 
 
 
348 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  35.91 
 
 
330 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  35.91 
 
 
330 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  35.91 
 
 
330 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  35.91 
 
 
330 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  33.12 
 
 
320 aa  160  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  36.48 
 
 
463 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  35.38 
 
 
355 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  35.61 
 
 
330 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  34.09 
 
 
314 aa  157  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  34.8 
 
 
316 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
316 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
316 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
316 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
316 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
316 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
316 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  34.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  34.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  34.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  34.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  34.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  34.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  34.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  34.48 
 
 
327 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  34.11 
 
 
320 aa  154  3e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  34.4 
 
 
284 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  34.87 
 
 
321 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  36.43 
 
 
329 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  36.08 
 
 
329 aa  147  2e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  33.44 
 
 
319 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  33.44 
 
 
319 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  33.44 
 
 
319 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  33.44 
 
 
319 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.65 
 
 
265 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  33.99 
 
 
441 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  33.99 
 
 
497 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  33.99 
 
 
325 aa  142  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  33.99 
 
 
325 aa  142  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  33.99 
 
 
333 aa  141  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  33.99 
 
 
327 aa  142  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  33.99 
 
 
329 aa  142  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  33.99 
 
 
325 aa  142  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  33.99 
 
 
325 aa  142  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  36.23 
 
 
277 aa  136  7e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  36.03 
 
 
303 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  38.76 
 
 
216 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  38.76 
 
 
216 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  38.42 
 
 
238 aa  119  8e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  38.65 
 
 
221 aa  117  2e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  35.81 
 
 
329 aa  117  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  35.81 
 
 
286 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  35.24 
 
 
206 aa  114  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  41.32 
 
 
178 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  34.05 
 
 
259 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  39.75 
 
 
188 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  38.73 
 
 
179 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  33.09 
 
 
316 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  33.09 
 
 
316 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  31.72 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  31.72 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  31.72 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  25.45 
 
 
481 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  30.21 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  36 
 
 
216 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  32.09 
 
 
316 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  29.86 
 
 
320 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  29.86 
 
 
320 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  30.94 
 
 
229 aa  84.7  2e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  29.45 
 
 
327 aa  83.2  6e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  29.45 
 
 
327 aa  83.2  6e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  25.43 
 
 
329 aa  82.8  8e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  30.77 
 
 
313 aa  82.4  9e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
280 aa  82.4  9e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  28.53 
 
 
325 aa  80.5  4e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  28.32 
 
 
328 aa  78.6  1e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  27.36 
 
 
314 aa  77.8  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  27.36 
 
 
314 aa  77.8  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  27.36 
 
 
314 aa  77.8  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  27.36 
 
 
314 aa  77.8  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  27.36 
 
 
314 aa  77.8  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>