More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4121 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  97.7 
 
 
261 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  94.98 
 
 
260 aa  492  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  94.53 
 
 
258 aa  487  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  93.75 
 
 
258 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  93.36 
 
 
258 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  93.75 
 
 
258 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  93.75 
 
 
258 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  91.41 
 
 
258 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  91.41 
 
 
258 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  92.22 
 
 
258 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  92.58 
 
 
258 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  91.41 
 
 
258 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  91.41 
 
 
258 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  91.41 
 
 
258 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  91.41 
 
 
258 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  91.41 
 
 
258 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  91.41 
 
 
258 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  82.33 
 
 
262 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  82.33 
 
 
262 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  81.53 
 
 
262 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  78.79 
 
 
263 aa  400  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  82.11 
 
 
266 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  78.05 
 
 
255 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  75.1 
 
 
255 aa  374  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  73.9 
 
 
264 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  74.29 
 
 
265 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  73.9 
 
 
264 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  74.29 
 
 
268 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  74.48 
 
 
263 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  73.88 
 
 
262 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  72.24 
 
 
256 aa  364  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  73.06 
 
 
244 aa  357  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  70.97 
 
 
268 aa  355  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  71.08 
 
 
268 aa  354  9e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  71.54 
 
 
251 aa  350  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  68.16 
 
 
240 aa  348  4e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  70.61 
 
 
255 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  70.61 
 
 
250 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  72.65 
 
 
240 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  66.12 
 
 
240 aa  325  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  62.14 
 
 
241 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  61.73 
 
 
241 aa  314  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  61.94 
 
 
247 aa  309  3e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  63.67 
 
 
241 aa  309  3e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  61.73 
 
 
241 aa  309  3e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60 
 
 
241 aa  305  4e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  61.48 
 
 
279 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
241 aa  304  9e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  60.66 
 
 
254 aa  303  1e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  57.84 
 
 
290 aa  304  1e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  58.05 
 
 
289 aa  304  1e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  61.04 
 
 
289 aa  304  1e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  58.96 
 
 
310 aa  303  2e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.78 
 
 
241 aa  303  2e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
246 aa  303  2e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  60.66 
 
 
277 aa  302  3e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.59 
 
 
241 aa  302  3e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  61.69 
 
 
282 aa  302  4e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  63.79 
 
 
239 aa  302  4e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59.51 
 
 
243 aa  301  6e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  61.89 
 
 
240 aa  301  6e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60 
 
 
241 aa  301  8e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 
249 aa  300  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 
243 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  60.89 
 
 
282 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  60.17 
 
 
249 aa  300  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  61.13 
 
 
243 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  61.13 
 
 
243 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.96 
 
 
241 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.78 
 
 
241 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.78 
 
 
241 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  61.13 
 
 
243 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.18 
 
 
241 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
241 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.78 
 
 
241 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.78 
 
 
241 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.78 
 
 
241 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  61.73 
 
 
283 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  61.13 
 
 
243 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  61.13 
 
 
243 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  61.13 
 
 
243 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  61.13 
 
 
243 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  62.3 
 
 
239 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  60.08 
 
 
333 aa  297  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.18 
 
 
241 aa  297  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.18 
 
 
241 aa  297  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  58.43 
 
 
261 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  58.7 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  57.81 
 
 
259 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  60.73 
 
 
243 aa  295  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91993e-05 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  61.07 
 
 
244 aa  295  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 
241 aa  295  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  60.91 
 
 
240 aa  295  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.26 
 
 
332 aa  295  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  57.48 
 
 
252 aa  295  7e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  58.54 
 
 
244 aa  294  9e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.59 
 
 
241 aa  293  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  59.59 
 
 
241 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>