244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2724 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  100 
 
 
437 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  67.97 
 
 
438 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  64.37 
 
 
438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  65.51 
 
 
424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  63.05 
 
 
425 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  60.78 
 
 
437 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  60.36 
 
 
444 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  61.02 
 
 
432 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  60.05 
 
 
441 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  58.58 
 
 
445 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  60.23 
 
 
431 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  57.44 
 
 
440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  57.64 
 
 
440 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  57.31 
 
 
424 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  60.05 
 
 
421 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  56.94 
 
 
434 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  55.66 
 
 
462 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  55.58 
 
 
429 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  58.2 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  58.2 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  57.24 
 
 
436 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  57.31 
 
 
430 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  57.31 
 
 
430 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  56.65 
 
 
434 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  56.58 
 
 
430 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  53.81 
 
 
429 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  56.94 
 
 
430 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  56.24 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  57.67 
 
 
435 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  56.91 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  56.44 
 
 
432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  57.67 
 
 
436 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  53.44 
 
 
426 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  54.76 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  54.67 
 
 
438 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  54.69 
 
 
431 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  51.24 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  50.69 
 
 
431 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  50.91 
 
 
434 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  51.24 
 
 
436 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  50.8 
 
 
434 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  50.34 
 
 
435 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  53.24 
 
 
431 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  50.68 
 
 
434 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  50.57 
 
 
434 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  51.03 
 
 
434 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  51.03 
 
 
434 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  49.66 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  50.34 
 
 
435 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  51.26 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  50.11 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  50 
 
 
886 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  50.11 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  50.11 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  50.11 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  50.11 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  49.77 
 
 
423 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  48.97 
 
 
441 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  49.52 
 
 
415 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  47.93 
 
 
423 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  47.93 
 
 
423 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  48.61 
 
 
429 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  49.11 
 
 
450 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  48.48 
 
 
420 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  47.61 
 
 
424 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  47.24 
 
 
422 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  46.54 
 
 
422 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  46.22 
 
 
422 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  42.89 
 
 
427 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  43.19 
 
 
427 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  46.05 
 
 
422 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  44.5 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  42.47 
 
 
429 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  45.39 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  46.71 
 
 
413 aa  349  6e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  48.01 
 
 
420 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  44.5 
 
 
418 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  46.88 
 
 
405 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  46.42 
 
 
421 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  48.8 
 
 
394 aa  333  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  46.88 
 
 
394 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  45.01 
 
 
413 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  45.01 
 
 
390 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  44.44 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  44.94 
 
 
401 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  44.23 
 
 
423 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  44.79 
 
 
412 aa  316  6e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  41.4 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  44 
 
 
398 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  42.82 
 
 
413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  42.65 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  43.59 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  44.5 
 
 
378 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  43.29 
 
 
391 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  40.6 
 
 
417 aa  296  6e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  45.07 
 
 
401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  41.51 
 
 
398 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  40.51 
 
 
412 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  40.66 
 
 
398 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  38.88 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>