51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4636 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  71.43 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  68.47 
 
 		 111 aa  160  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  53.7 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  57.28 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  57 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  57 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  50.94 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  55.34 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  59.8 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  41.12 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  40.19 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  42.99 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  42.99 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  40.19 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  41.12 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  41.12 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  41.12 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  40.19 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  41.12 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  41.12 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  41.28 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  42.71 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  42.71 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  42.71 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  42.71 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  42.71 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  42.71 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  39.25 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  38.53 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  40.62 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  39.25 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  35.87 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  30.1 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  32.11 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  34.88 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  34.88 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  29.55 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  31.43 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  34.21 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  31.87 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  32.26 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  30 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  30.11 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>