35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4208 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  214  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  93.75 
 
 
112 aa  206  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  92.86 
 
 
112 aa  202  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  93.58 
 
 
112 aa  197  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  96.33 
 
 
112 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  96.33 
 
 
112 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  96.33 
 
 
112 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  81.13 
 
 
107 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  80.19 
 
 
107 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  80.19 
 
 
107 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  78.7 
 
 
113 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  51.52 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  43.16 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  40.43 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  39.36 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  39.36 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  30 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  31.73 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  35.63 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
111 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  37.61 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  33.66 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  31.37 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  41.51 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  28.97 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  28.97 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  35.96 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  32.61 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  31.58 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  30.43 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  32.99 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  36.23 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  35.79 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>