35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1095 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
112 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
112 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
112 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  92.66 
 
 
112 aa  196  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  91.74 
 
 
112 aa  196  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  90.83 
 
 
112 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  96.33 
 
 
112 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  79.63 
 
 
113 aa  167  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  78.3 
 
 
107 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 
107 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  77.36 
 
 
107 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  52 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  43.16 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  40.43 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  39.36 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  36 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  30 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  39.36 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  34.48 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  40.37 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  31.68 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  29.29 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  29.29 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  40.57 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  31.58 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  32.5 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  35.23 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  36.08 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  30.43 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  31.96 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>