More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0086 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  75.31 
 
 
481 aa  748  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  75.1 
 
 
481 aa  749  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  71.91 
 
 
480 aa  672  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  76.31 
 
 
482 aa  759  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  81.42 
 
 
479 aa  795  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  100 
 
 
505 aa  1025  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  75.52 
 
 
481 aa  731  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  75.52 
 
 
481 aa  732  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  78.45 
 
 
478 aa  738  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  79.04 
 
 
480 aa  736  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  78.45 
 
 
478 aa  749  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  78.66 
 
 
478 aa  750  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  75.31 
 
 
481 aa  748  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  75.89 
 
 
481 aa  737  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  76.31 
 
 
481 aa  739  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  75.73 
 
 
481 aa  733  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  70.08 
 
 
479 aa  684  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  75.73 
 
 
481 aa  733  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.71 
 
 
476 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  63.29 
 
 
482 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  63.58 
 
 
476 aa  612  1e-174  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  62.37 
 
 
477 aa  607  1e-172  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  62.37 
 
 
477 aa  606  1e-172  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  62.5 
 
 
477 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  61.91 
 
 
477 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  62.29 
 
 
477 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  63.39 
 
 
478 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  61.47 
 
 
480 aa  595  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  61.6 
 
 
478 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  60.25 
 
 
477 aa  577  1e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  61.26 
 
 
477 aa  571  1e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  59.16 
 
 
481 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
476 aa  567  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  61.81 
 
 
477 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.45 
 
 
475 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.41 
 
 
476 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.81 
 
 
475 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.45 
 
 
496 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  52.53 
 
 
475 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.95 
 
 
485 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.89 
 
 
477 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  50.42 
 
 
477 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
478 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
478 aa  470  1e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
485 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
495 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
478 aa  459  1e-128  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  50.62 
 
 
477 aa  459  1e-128  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
487 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  48.71 
 
 
476 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
493 aa  454  1e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  49.17 
 
 
477 aa  447  1e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.11 
 
 
477 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.89 
 
 
476 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.55 
 
 
476 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
485 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
479 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
500 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 
486 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.92 
 
 
500 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
493 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  44.03 
 
 
483 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.91 
 
 
487 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.88 
 
 
483 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
483 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.93 
 
 
482 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.15 
 
 
484 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.93 
 
 
482 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
493 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.38 
 
 
509 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.43 
 
 
480 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.93 
 
 
482 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
489 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.93 
 
 
482 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 
480 aa  379  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.91 
 
 
489 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
489 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.08 
 
 
488 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
484 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
489 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.04 
 
 
482 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
478 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
489 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.57 
 
 
489 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.22 
 
 
480 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
489 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.22 
 
 
480 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.27 
 
 
501 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
492 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.83 
 
 
482 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.22 
 
 
480 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.62 
 
 
482 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.73 
 
 
494 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.41 
 
 
485 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.65393e-18 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
485 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.49 
 
 
484 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.43 
 
 
483 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.36 
 
 
489 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
489 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.36 
 
 
483 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>