More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3237 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 325 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  89.07 
 
 		 328 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  80.36 
 
 		 339 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  79.49 
 
 		 329 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  79.68 
 
 		 329 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 329 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  79.03 
 
 		 329 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  79.03 
 
 		 329 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  79.03 
 
 		 329 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  79.03 
 
 		 329 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  78.71 
 
 		 329 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  68.14 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  68.14 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  68.14 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 319 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  67.82 
 
 		 322 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  66.25 
 
 		 319 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  66.14 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  57.65 
 
 		 294 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  57.65 
 
 		 294 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  57.54 
 
 		 296 aa  345  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  52.72 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  52.96 
 
 		 339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 312 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 312 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 312 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 297 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  52.31 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  41.94 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  40.86 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  38.21 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  39.43 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  41.76 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  39.78 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  37.63 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  36.92 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  43.61 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  45.9 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  35.67 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  38.13 
 
 		 326 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  38.21 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  32.37 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  34.28 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 302 aa  176  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.69 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  30.24 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  29.3 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.97 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4043  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2701  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.5 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.485012  normal  0.370839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.89 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.98 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.08 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 281 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>