42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7144 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 434 aa  885    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  36.6 
 
 		 483 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  32.17 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  35.99 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  30.48 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  27.42 
 
 		 437 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  27.57 
 
 		 423 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  27.34 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  26.56 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1305  hypothetical protein  27.51 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  23.21 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  25.74 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  20.86 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  22.68 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  24.65 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  24.7 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  22.68 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  24.66 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  24.66 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  24.55 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  23.45 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  22.67 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  24.21 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  21.3 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  22.13 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.66 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  22.13 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  23.39 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  22.88 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  23.49 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  22.57 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  24.4 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  22.97 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  21.9 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  21.9 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  23.89 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  23.19 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  22.48 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  25 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  26.92 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  24.4 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0840  major capsid protein HK97  26.79 
 
 		 313 aa  43.1  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>