More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6660 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
297 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  73.17 
 
 
332 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  73.17 
 
 
350 aa  459  1e-128  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  73.17 
 
 
339 aa  458  1e-128  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  73.17 
 
 
332 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  73.17 
 
 
350 aa  459  1e-128  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  73.17 
 
 
332 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  73.17 
 
 
318 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  73.17 
 
 
330 aa  457  1e-128  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  70.03 
 
 
312 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  70.03 
 
 
312 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  70.03 
 
 
312 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  69.69 
 
 
311 aa  441  1e-122  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  52.53 
 
 
339 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  52.53 
 
 
329 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  52.53 
 
 
325 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  52.96 
 
 
329 aa  327  2e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  54.3 
 
 
319 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  52.61 
 
 
329 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  52.61 
 
 
329 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  53.61 
 
 
319 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  53.61 
 
 
319 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  53.95 
 
 
319 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  52.26 
 
 
329 aa  321  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  53.95 
 
 
319 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  53.95 
 
 
319 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  52.26 
 
 
329 aa  321  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  52.26 
 
 
329 aa  321  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  52.26 
 
 
329 aa  321  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  53.61 
 
 
322 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  51.94 
 
 
328 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  49.47 
 
 
294 aa  301  6e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  49.12 
 
 
294 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  50.35 
 
 
296 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  45.04 
 
 
294 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  49.79 
 
 
256 aa  239  6e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 
310 aa  233  4e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 
321 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
301 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 
309 aa  221  1e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  40.28 
 
 
301 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  6.88741e-11  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  38.08 
 
 
298 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
315 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 
301 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  43.7 
 
 
325 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
303 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  36.56 
 
 
315 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  41.48 
 
 
287 aa  214  1e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
301 aa  214  1e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  39.79 
 
 
301 aa  213  4e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 
309 aa  212  6e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  40.28 
 
 
307 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  40.28 
 
 
301 aa  211  8e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  37.81 
 
 
299 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 
315 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 
299 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  38.08 
 
 
311 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.18709e-05  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
308 aa  200  2e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  36.52 
 
 
326 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  35.99 
 
 
303 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.08 
 
 
319 aa  190  3e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 
326 aa  189  6e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
302 aa  173  3e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  32.38 
 
 
296 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 
290 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  3.61988e-11 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 
289 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 
323 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 
318 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.30517e-05  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 
291 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 
318 aa  148  1e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 
302 aa  148  1e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 
318 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
325 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.15 
 
 
289 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 
327 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2546  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  29.82 
 
 
284 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 
327 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 
291 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 
295 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 
301 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 
289 aa  141  2e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3940  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
325 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4427  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
325 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3588  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
325 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0511949  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
324 aa  138  9e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
324 aa  138  9e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0666  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 
322 aa  138  9e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
324 aa  138  9e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
324 aa  138  9e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
324 aa  138  9e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 
292 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
324 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  29.54 
 
 
288 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 
286 aa  137  3e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 
324 aa  135  6e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 
291 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 
324 aa  134  1e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.45 
 
 
289 aa  135  1e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 
324 aa  134  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 
324 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>