33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0803 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
107 aa  204  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  87.85 
 
 
107 aa  184  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  87.85 
 
 
107 aa  182  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  81.13 
 
 
112 aa  167  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 
112 aa  164  3e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  77.36 
 
 
112 aa  162  2e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  80.19 
 
 
112 aa  153  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  77.36 
 
 
112 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.16861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  77.36 
 
 
112 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  77.36 
 
 
112 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  67.92 
 
 
113 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  48.45 
 
 
109 aa  79.7  1e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  49 
 
 
109 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  38.54 
 
 
107 aa  61.2  4e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  38.54 
 
 
107 aa  60.1  9e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  37 
 
 
111 aa  55.8  2e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  37.93 
 
 
108 aa  55.5  2e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  37.25 
 
 
108 aa  50.8  6e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  31.73 
 
 
103 aa  50.8  6e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 
108 aa  50.1  1e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  48.1  4e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  34 
 
 
107 aa  47.8  5e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  39.53 
 
 
108 aa  47.4  6e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  35.71 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  32.98 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  29 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  32.91 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  29.9 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  31.96 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  32.32 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>