More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30580 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
272 aa  530  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  55.06 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  58.4 
 
 
269 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  56.7 
 
 
273 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  49.82 
 
 
272 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  50 
 
 
283 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  51.52 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  48.52 
 
 
271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  50.38 
 
 
265 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  51.15 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  46.79 
 
 
270 aa  235  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  45.02 
 
 
285 aa  232  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  49.62 
 
 
272 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.17 
 
 
296 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  49.25 
 
 
267 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  44.62 
 
 
313 aa  216  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.37 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.5 
 
 
243 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
270 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  26.61 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  38.35 
 
 
263 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  42.73 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  30.5 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  37.93 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.85 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  41.12 
 
 
286 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  27.83 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  33.95 
 
 
624 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.56 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.56 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  43.12 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  30.45 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  41.12 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.87 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  34.18 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  32.61 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  40.19 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.44 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  38.94 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.1 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  38.21 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  38.21 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  40.34 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  38.21 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  42.27 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.96 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.27 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  29 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  45.54 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.1 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.61 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  31.03 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.5 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.72 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.12 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.39 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  34.96 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  31.58 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
237 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.5 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.61 
 
 
265 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  44.55 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  44.55 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  44.55 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  37.34 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.89 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  32.2 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.58 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>