30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  735    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  38.07 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  38.07 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  34.22 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  32.08 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  35.01 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  28.42 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  24.01 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  27.19 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  27.13 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  26.58 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  29.61 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  24.73 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  23.91 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  29.19 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  26.87 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  23.79 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  27.59 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  29.33 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  26.67 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  26.05 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  27.13 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  21.38 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  24.93 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  27.81 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  27.92 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  26.97 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0445  hypothetical protein  40.24 
 
 		 130 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00422073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  24.78 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  26.33 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>