187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2794 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  73.58 
 
 
107 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  60 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  58.88 
 
 
112 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  66.67 
 
 
115 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 
152 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
128 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  48.11 
 
 
123 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  48.11 
 
 
123 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  49.5 
 
 
125 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  47.12 
 
 
132 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  60 
 
 
138 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  47.57 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  47.57 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  47.92 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  47.52 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  47.57 
 
 
162 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  40.66 
 
 
127 aa  90.1  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
141 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  48.35 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  45.71 
 
 
137 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  39.56 
 
 
114 aa  84.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  45.71 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  41.58 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  42.45 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  50.57 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  53.57 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  37.93 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  54.55 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  43.68 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  41.75 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  47.25 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40.96 
 
 
272 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  48.05 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  43.24 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  51.72 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
276 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  41.11 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  37.18 
 
 
263 aa  67.4  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  49.38 
 
 
120 aa  67  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  39.74 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  39.74 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  39.74 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  44.55 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  38.04 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.27 
 
 
263 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  39.74 
 
 
270 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  40.7 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  41.56 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  36.25 
 
 
242 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  37.25 
 
 
257 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  37.97 
 
 
125 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  35.53 
 
 
268 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
263 aa  59.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  37.18 
 
 
270 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  38.67 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  31.37 
 
 
263 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  34.18 
 
 
270 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  32.5 
 
 
245 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.25 
 
 
260 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  42.35 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  32.18 
 
 
263 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  45.21 
 
 
267 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
236 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  35.06 
 
 
263 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  40.23 
 
 
370 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  37.8 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  36.71 
 
 
266 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  38.3 
 
 
346 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  38.38 
 
 
259 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
247 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
290 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  28.09 
 
 
195 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  35.92 
 
 
258 aa  53.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
261 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  38.3 
 
 
345 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  40.7 
 
 
269 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  37.37 
 
 
259 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  42.31 
 
 
265 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  44.74 
 
 
268 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
254 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  39.53 
 
 
269 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.62 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  38.2 
 
 
259 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  38.2 
 
 
259 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  38.2 
 
 
259 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
254 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
254 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
266 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  39.24 
 
 
264 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.05 
 
 
281 aa  50.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.42 
 
 
269 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.33 
 
 
254 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>