51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2314 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
181 aa  349  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  56.03 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  54.74 
 
 
157 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  46.32 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  48.55 
 
 
141 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  43.88 
 
 
147 aa  85.1  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  45.39 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  40.43 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  47.2 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  43.97 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  37.96 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  39.44 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  49.67 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  40.48 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  45.53 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  34.97 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  43.97 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  38.93 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  43.36 
 
 
144 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  43.36 
 
 
144 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  43.36 
 
 
144 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  43.26 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  35.04 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  34.58 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  30.6 
 
 
136 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  38.3 
 
 
144 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  38.82 
 
 
167 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  37.14 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  41.94 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  43.9 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  38.3 
 
 
142 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  31.54 
 
 
141 aa  57.8  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  38.24 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  29.2 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  30.22 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  38.24 
 
 
143 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  55.1  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  42.18 
 
 
158 aa  55.1  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.89 
 
 
149 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  37.41 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  37.76 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  38.64 
 
 
143 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  32.46 
 
 
146 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  32.2 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1131  hypothetical protein  29.2 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  25.76 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  30.39 
 
 
458 aa  41.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  22.58 
 
 
133 aa  40.8  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>