More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0019 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
173 aa  352  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  70.06 
 
 
179 aa  250  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  66.1 
 
 
179 aa  241  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  68.24 
 
 
181 aa  235  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  68.24 
 
 
181 aa  234  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  69.19 
 
 
176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  70.62 
 
 
179 aa  228  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  68.93 
 
 
179 aa  227  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  65.68 
 
 
177 aa  225  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  65.29 
 
 
175 aa  222  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  68.42 
 
 
177 aa  221  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  65.29 
 
 
175 aa  220  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  67.8 
 
 
184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  60.34 
 
 
178 aa  213  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  61.54 
 
 
174 aa  210  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  64.37 
 
 
193 aa  209  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  60.36 
 
 
178 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  65.09 
 
 
182 aa  205  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  60.36 
 
 
174 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  64.91 
 
 
170 aa  204  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  61.54 
 
 
181 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  60.95 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  63.91 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  63.31 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  65.68 
 
 
173 aa  195  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  56.8 
 
 
176 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
182 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.5 
 
 
182 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  63.58 
 
 
170 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  61.4 
 
 
172 aa  187  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
178 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.43 
 
 
189 aa  185  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  54.71 
 
 
172 aa  180  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  61.54 
 
 
182 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  56.21 
 
 
188 aa  178  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  54.12 
 
 
172 aa  176  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  56.21 
 
 
188 aa  175  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  60.36 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  58.48 
 
 
176 aa  170  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  51.48 
 
 
287 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  52.35 
 
 
176 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  56.98 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.44 
 
 
201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  51.46 
 
 
266 aa  160  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
241 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  66.67 
 
 
168 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  65.69 
 
 
168 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  65.93 
 
 
168 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  65.69 
 
 
168 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  49.42 
 
 
657 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  56.8 
 
 
228 aa  151  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  56.03 
 
 
310 aa  151  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  47.67 
 
 
629 aa  150  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.9 
 
 
310 aa  145  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.65 
 
 
376 aa  145  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  48.81 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.02 
 
 
378 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50 
 
 
310 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  51.02 
 
 
218 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  46.51 
 
 
665 aa  135  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  44.31 
 
 
571 aa  134  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42 
 
 
196 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.34 
 
 
357 aa  131  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.03 
 
 
202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.79 
 
 
466 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  55.07 
 
 
223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  47.09 
 
 
629 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  45.83 
 
 
178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.24 
 
 
372 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  53.59 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  47.75 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.2 
 
 
468 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
376 aa  124  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.9 
 
 
230 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.9 
 
 
230 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  44.64 
 
 
172 aa  123  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  40.8 
 
 
197 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.57 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.78 
 
 
322 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1082  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.97 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  44.17 
 
 
184 aa  118  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.98 
 
 
164 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02320  conserved hypothetical protein  41.62 
 
 
491 aa  118  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.06 
 
 
197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  48.98 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  45.18 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  53.28 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  47.62 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  43.29 
 
 
366 aa  115  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  48.3 
 
 
164 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.83 
 
 
219 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  43.26 
 
 
573 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7102  predicted protein  46.91 
 
 
164 aa  114  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0596707 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  38.73 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0954  peptidylprolyl isomerase  38.54 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0973  peptidylprolyl isomerase  38.54 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>