294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6032 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  76.52 
 
 		 570 aa  755    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  76.52 
 
 		 616 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  89.84 
 
 		 566 aa  937    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  87.76 
 
 		 616 aa  866    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  77.1 
 
 		 567 aa  786    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  90.03 
 
 		 569 aa  900    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 		 572 aa  1105    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  90.03 
 
 		 569 aa  900    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  76.52 
 
 		 570 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  76.52 
 
 		 570 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  89.16 
 
 		 566 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  56.29 
 
 		 567 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  56.12 
 
 		 567 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5789  Dak phosphatase  97.69 
 
 		 260 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  43.93 
 
 		 580 aa  392  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  34.06 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  35.33 
 
 		 583 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  35.52 
 
 		 583 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  35.52 
 
 		 583 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  36.22 
 
 		 583 aa  343  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  35.35 
 
 		 583 aa  342  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  36.22 
 
 		 583 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  36.57 
 
 		 583 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  36.05 
 
 		 583 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  37.96 
 
 		 577 aa  339  8e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  35.88 
 
 		 583 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  35.47 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  36.05 
 
 		 583 aa  336  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.89 
 
 		 332 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.23 
 
 		 332 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.14 
 
 		 329 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  41.76 
 
 		 544 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.48 
 
 		 332 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.95 
 
 		 333 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2432  Glycerone kinase  41.34 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  36.19 
 
 		 539 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  38.83 
 
 		 544 aa  290  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.73 
 
 		 332 aa  289  9e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.63 
 
 		 331 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.85 
 
 		 332 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.46 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  47.58 
 
 		 332 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  37.83 
 
 		 546 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.88 
 
 		 333 aa  283  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  36.82 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.69 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  36.82 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.11 
 
 		 333 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  45.67 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  36.47 
 
 		 581 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  39.65 
 
 		 568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  35.21 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  35.86 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.05 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  38.22 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.03 
 
 		 322 aa  268  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.48 
 
 		 355 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.03 
 
 		 322 aa  268  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.04 
 
 		 329 aa  266  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.34 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.4 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.4 
 
 		 333 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.35 
 
 		 330 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.05 
 
 		 330 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  41.51 
 
 		 545 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.36 
 
 		 354 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.25 
 
 		 331 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  33.28 
 
 		 589 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.35 
 
 		 332 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  32.76 
 
 		 595 aa  259  9e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.78 
 
 		 354 aa  257  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.05 
 
 		 332 aa  257  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.79 
 
 		 354 aa  257  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0893  Glycerone kinase  37.31 
 
 		 546 aa  256  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.05 
 
 		 369 aa  256  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  40.64 
 
 		 560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.88 
 
 		 332 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.29 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  38.1 
 
 		 556 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.29 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.15 
 
 		 333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  41.29 
 
 		 356 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.29 
 
 		 356 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  41.29 
 
 		 356 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.97 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.29 
 
 		 356 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.22 
 
 		 364 aa  255  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  41.59 
 
 		 694 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.05 
 
 		 333 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.29 
 
 		 356 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.98 
 
 		 354 aa  253  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  35.99 
 
 		 581 aa  253  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.55 
 
 		 331 aa  252  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1031  Glycerone kinase  43.15 
 
 		 545 aa  250  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593318  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  38 
 
 		 544 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  38 
 
 		 544 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  37.82 
 
 		 544 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00034  dihydroxyacetone kinase (Eurofung)  34.45 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.160552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2326  Glycerone kinase  37.48 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>