262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2487 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  99.53 
 
 
214 aa  430  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  93.46 
 
 
214 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  93.46 
 
 
214 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  93.46 
 
 
214 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  91.59 
 
 
214 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  90.65 
 
 
214 aa  400  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.11 
 
 
214 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.11 
 
 
214 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.11 
 
 
214 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.11 
 
 
214 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.11 
 
 
214 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  2.3808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.11 
 
 
214 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.58 
 
 
265 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  9.6585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  84.11 
 
 
214 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  77.1 
 
 
212 aa  342  3e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  75.23 
 
 
213 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  75.7 
 
 
213 aa  328  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.76 
 
 
212 aa  301  5e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.42 
 
 
212 aa  289  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.49 
 
 
212 aa  283  2e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.49 
 
 
212 aa  282  2e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.02 
 
 
212 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.26 
 
 
211 aa  273  2e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.03 
 
 
224 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.09 
 
 
215 aa  265  3e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.85 
 
 
211 aa  265  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.74 
 
 
211 aa  264  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.56 
 
 
215 aa  262  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.09 
 
 
214 aa  259  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.48 
 
 
213 aa  258  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.69 
 
 
214 aa  258  5e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.01004e-05 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.18 
 
 
258 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
226 aa  256  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.44 
 
 
211 aa  254  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.48 
 
 
211 aa  253  1e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.09 
 
 
212 aa  253  1e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.81 
 
 
213 aa  252  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.19 
 
 
225 aa  251  5e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.69 
 
 
215 aa  251  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.22 
 
 
217 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.75 
 
 
214 aa  248  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.94 
 
 
239 aa  248  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.43 
 
 
214 aa  246  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.96 
 
 
212 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.75 
 
 
217 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.87 
 
 
210 aa  245  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.43 
 
 
213 aa  244  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.38 
 
 
229 aa  244  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.35 
 
 
211 aa  243  1e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.28 
 
 
217 aa  243  1e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.6 
 
 
215 aa  241  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  57.55 
 
 
217 aa  238  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.89 
 
 
202 aa  238  6e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.75 
 
 
214 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.21 
 
 
215 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.61 
 
 
217 aa  236  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.28 
 
 
215 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.74 
 
 
215 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.42 
 
 
215 aa  233  2e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.28 
 
 
215 aa  231  8e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.07 
 
 
215 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.88 
 
 
215 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.36 
 
 
212 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.36 
 
 
212 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.49 
 
 
215 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.3 
 
 
211 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.02 
 
 
215 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.46 
 
 
261 aa  221  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.56 
 
 
215 aa  219  2e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.11 
 
 
221 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.23 
 
 
215 aa  217  9e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.78 
 
 
225 aa  215  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.64 
 
 
231 aa  213  2e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.7 
 
 
224 aa  211  8e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1481  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.6 
 
 
217 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  0.265561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.07 
 
 
213 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.07 
 
 
214 aa  208  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29241  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.47 
 
 
222 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.59 
 
 
212 aa  207  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53 
 
 
218 aa  207  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.06 
 
 
215 aa  205  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0734  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.55 
 
 
213 aa  204  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.75 
 
 
212 aa  204  9e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  46.01 
 
 
215 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  46.7 
 
 
212 aa  201  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01070  pyridoxamine-phosphate oxidase, putative  48.84 
 
 
268 aa  201  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  45.54 
 
 
215 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33810  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.36 
 
 
222 aa  200  1e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.24 
 
 
215 aa  199  2e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7230  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.22 
 
 
254 aa  200  2e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.714905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0831  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.42 
 
 
218 aa  199  2e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.55 
 
 
200 aa  199  4e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
217 aa  198  4e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
217 aa  199  4e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
217 aa  199  4e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.05 
 
 
227 aa  198  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0604494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.64 
 
 
233 aa  198  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.52 
 
 
213 aa  197  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.84 
 
 
213 aa  197  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>