More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1344 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.52 
 
 
525 aa  647  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  79.84 
 
 
521 aa  800  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  82.32 
 
 
516 aa  838  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  72.55 
 
 
513 aa  775  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  81.69 
 
 
515 aa  849  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  61.9 
 
 
525 aa  649  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  72.75 
 
 
513 aa  771  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  100 
 
 
524 aa  1062  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  70.86 
 
 
511 aa  733  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  95.42 
 
 
524 aa  976  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  62.87 
 
 
523 aa  644  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  99.05 
 
 
524 aa  1054  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  72.4 
 
 
512 aa  761  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  72.55 
 
 
513 aa  768  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  68.76 
 
 
503 aa  699  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  95.42 
 
 
524 aa  995  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  95.42 
 
 
524 aa  995  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  95.42 
 
 
524 aa  1018  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  83.21 
 
 
518 aa  882  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  94.31 
 
 
527 aa  989  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  58.57 
 
 
494 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  55.78 
 
 
500 aa  562  1e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.52 
 
 
504 aa  508  1e-142  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 
506 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  51.93 
 
 
499 aa  502  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.9 
 
 
506 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.9 
 
 
506 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.7 
 
 
506 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  50.3 
 
 
502 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
506 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
506 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  49.6 
 
 
506 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
506 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
506 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
506 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  49.6 
 
 
506 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
506 aa  498  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
506 aa  494  1e-138  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
506 aa  494  1e-138  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
506 aa  494  1e-138  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  48.89 
 
 
514 aa  493  1e-138  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.43 
 
 
512 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 
506 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 
502 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 
506 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  51.26 
 
 
512 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 
515 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  51.42 
 
 
512 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  52.23 
 
 
513 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  50.5 
 
 
514 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  51.49 
 
 
513 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
505 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 
506 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  51.42 
 
 
512 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 
515 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
504 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  48.79 
 
 
494 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.1797e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  48.38 
 
 
498 aa  479  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  50.3 
 
 
507 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
501 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  47.84 
 
 
524 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  49.6 
 
 
501 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
497 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
501 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  50.4 
 
 
503 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  50.6 
 
 
503 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  49.7 
 
 
508 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  47.76 
 
 
501 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  47.09 
 
 
500 aa  470  1e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  48.08 
 
 
496 aa  470  1e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  46.02 
 
 
516 aa  469  1e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  47.98 
 
 
503 aa  470  1e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  48.57 
 
 
494 aa  471  1e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.55 
 
 
508 aa  466  1e-130  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  48.69 
 
 
499 aa  466  1e-130  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  47.61 
 
 
513 aa  466  1e-130  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.91 
 
 
514 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.91 
 
 
514 aa  467  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  48.69 
 
 
499 aa  466  1e-130  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  50.49 
 
 
525 aa  463  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  48.12 
 
 
515 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  48.79 
 
 
516 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.71 
 
 
514 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  46.17 
 
 
503 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  47.07 
 
 
499 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  45.62 
 
 
516 aa  459  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.62 
 
 
516 aa  458  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.62 
 
 
516 aa  459  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44.44 
 
 
496 aa  461  1e-128  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  50 
 
 
504 aa  459  1e-128  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  46.52 
 
 
501 aa  459  1e-128  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  47.93 
 
 
517 aa  459  1e-128  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  46.52 
 
 
501 aa  459  1e-128  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  46.06 
 
 
511 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0800  ABC transporter related  46.8 
 
 
509 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  47.76 
 
 
505 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  45.75 
 
 
499 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.31 
 
 
501 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  46.31 
 
 
501 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  46.31 
 
 
501 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>