More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0328 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 978 aa  1064    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 925 aa  706    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 802 aa  729    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 949 aa  1022    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 802 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 922 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 833 aa  690    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 805 aa  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 802 aa  728    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 802 aa  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 802 aa  728    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 802 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 807 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 1016 aa  974    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 985 aa  1088    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 987 aa  2042    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 944 aa  708    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 802 aa  726    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 949 aa  1067    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 805 aa  699    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 971 aa  1039    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  79.2 
 
 		 994 aa  1639    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 805 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 805 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 805 aa  668    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 802 aa  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 984 aa  1260    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 838 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 1064 aa  984    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 923 aa  708    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 954 aa  1120    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 958 aa  1076    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 952 aa  1040    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 		 952 aa  1096    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 840 aa  644    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 906 aa  746    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 802 aa  730    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 954 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 971 aa  1039    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 963 aa  1043    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 969 aa  725    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 921 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 950 aa  1074    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 835 aa  649    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 984 aa  1099    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 802 aa  729    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 857 aa  750    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 806 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 829 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 808 aa  680    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 833 aa  693    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 		 990 aa  1241    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  63.52 
 
 		 978 aa  1243    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 936 aa  727    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 951 aa  1036    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 936 aa  778    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 968 aa  1204    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 949 aa  735    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 971 aa  1039    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 802 aa  731    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 968 aa  1044    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  60.9 
 
 		 982 aa  1224    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 934 aa  1072    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 969 aa  985    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 806 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 801 aa  622  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  39.47 
 
 		 899 aa  611  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 858 aa  592  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 857 aa  591  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 804 aa  582  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  43.71 
 
 		 879 aa  580  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 854 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 830 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 824 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 806 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 800 aa  556  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 810 aa  559  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 865 aa  555  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 854 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 851 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 804 aa  550  1e-155  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 824 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7138  leucyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 828 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 801 aa  546  1e-154  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 865 aa  545  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 805 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 865 aa  543  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 828 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 805 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 806 aa  542  9.999999999999999e-153  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 813 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 813 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 829 aa  542  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 813 aa  538  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 816 aa  537  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 804 aa  537  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 864 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 815 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 863 aa  525  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 870 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>